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Una suite de análisis de genoma complejo
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  • Rating:
  • Licencia:
  • GPL
  • Nombre del editor:
  • UniPro
  • Sistemas operativos:
  • Windows All
  • Tamaño del archivo:
  • 12.2 MB

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Ane Descripción

Ugene es una suite de análisis genoma integral que cuenta con una alineación de secuencia múltiple y un constructor de HMM y un módulo de búsqueda complejo. Ugene es una herramienta práctica que también ofrece una experiencia de navegación de genoma visual e interactiva. También disponible: Ugene portátil Principales características: Alineación de secuencias múltiples con músculo 3 y músculo 4; Los perfiles HMM construyen y buscan, según la fuente de Hmmer 2 y Hmmer 3; PRIMERS DE PRIMEROS DE PCR utilizando PRIMER 3; Predicción de la estructura secundaria de la proteína utilizando GOR IV y PSIPRED; Búsqueda de enzimas de restricción e integración con Rebase; Buscador de repetición extremadamente rápido; Búsqueda de sitios de encuadernación del factor de transcripción usando Sitecon; orf buscador; Completa la implementación de algoritmo Smith-Waterman. Visualización de cromatogramas ; Visor 3D para archivos en formatos PDB y MMDB; Editor de alineación de secuencia múltiple; Diseñador de flujo de trabajo fácil de usar para flujos de trabajo computacionales personalizados. Soporte completo de los procesadores multinúcrafos modernos y las instrucciones de SSE; Fuera de la caja Soporte de GPU modernas utilizando NVIDIA CUDA y ATI Stream; Soluciones integradas para el motor de banda ancha celular; Soluciones privadas para supercomputadores y computación distribuida.


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