 | FragmentationAnalyzerUna herramienta de Java independiente para analizar datos de fragmentación MS / MS |
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FragmentationAnalyzer Clasificación y resumen
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FragmentationAnalyzer Descripción
El analizador de fragmentación es un instrumento de código abierto basado en Java que se puede utilizar para analizar los datos de fragmentación MS / MS. Se admiten nueve tipos de análisis diferentes: · Visualización de espectros: visualice los espectros MS / MS con la anotación de iones de fragmento, el zoom y la secuenciación manual de NOVO. · Parcelas de la caja de intensidad: analizar la variación de intensidad para un conjunto de identificación del mismo péptido. · Correlación de intensidad: detecta cómo la intensidad se correlaciona con la propagación de la intensidad. · Intensidad Meta PLOTS: analiza aún más las variaciones en la intensidad. · Error de masa Scatter PLOCT: visualice la propagación de errores de masa en un conjunto de identificaciones / espectros seleccionados. · Parcelas de burbujas de error masivo: igual que las parcelas de dispersión de errores masivos pero con intensidades máximas agregadas. · Caja de errores de masa: analiza la variación en errores masivos. · Patrón de probabilidad de iones de fragmento: analice la probabilidad de observar iones de fragmentos específicos. · Mapa de calor de iones de fragmento: compare la fragmentación utilizando los mapas de calor de los datos de correlación. Principales características: Admite tres formatos de entrada: ms_lims 7 Mascot Dat Files OMSSA OMX archivos
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