Mono Un editor de plásmidos pequeños y fáciles de usar
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APE se desarrolló para ser un editor de plásmidos pequeño y fácil de usar. Principales características: resalta los sitios de restricción en la ventana de edición refleja con precisión el bloqueo de DAM / DCM de los sitios de enzimas Destaca el texto usando bibliotecas de características predefinidas y personalizadas muestra traducción, TM,% GC, ORF del ADN seleccionado en tiempo real lee los archivos ADN Strider, Fasta, Genbank y EMBL guarda archivos como formato de archivo compatible con ADN Strider-Compatible o GenBank Destaca y dibuja mapas gráficos con anotaciones de características de los archivos GenBank y EMBL exploró directamente la secuencia seleccionada en NCBI o WormBase El mapa de texto muestra la secuencia de ADN, la traducción y las características como gráficos basados ​​en texto crea mapas de restricción gráfica: lineal o circular con características indicadas Conecta características gráficas y de texto con hipervínculo doble clic ahorra gráficos como PostScript o gráficos vectoriales escalables escalable Copie y guarde gráficos como METÁFICOS DE WINDOWS (SOP Windows solamente) Restricción virtual Digest Dibuja escaleras de ADN predefinidas y definidas por el usuario conecta las bandas al texto por doble clic lee los archivos de seguimiento de secuenciación de ABI Las secuencias en las trazas de ABI se pueden alinear directamente a una secuencia de referencia, con la alineación de la recuperación del hipervínculo a TE. Selecciona los sitios que coinciden con múltiples criterios (Unión / Frecuencia de corte de intersección, Tipo de sitio) En todas las ventanas abiertas Selecciona los sitios que cortan más a menudo en una secuencia que otra (para detección de SNIP-SNP o digestiones de diagnóstico) tiene una agrupación de enzimas definida por el usuario para distiguió, por ejemplo. Enzimas actualmente en stock. Permite a los usuarios definir nuevas enzimas por nombre y sitio de reconocimiento Importa archivos de formato de ARTVIDER DE ADN (enzimas simples, listas de sitios) disponibles en Rebase La mayoría de las ventanas de análisis están hipervinadas a sus secuencias correspondientes, incluyendo: Mapas gráficos Mapas de texto Digestes virtuales Alineamientos (incluyendo secuencias de ABI) Sitios silenciosos traducción Primer Encuentra utiliza bibliotecas de definición de características personalizadas, que permiten: anotación rápida de secuencia Búsqueda rápida y resaltado de todos los cebadores disponibles que usted (u otros) ha hibridado a una secuencia Secuencia para anotarse y visualizar en múltiples formas de manera rápida y eficiente Mapas gráficos que muestran sitios de unión a cebadores y todas las características de secuencia interesantes traduce secuencias con alineación de ADN opcional encuentra imprimibles potenciales que coinciden con los criterios de usuario (longitud, TM,% GC, auto / otras complementariedad) alinea dos secuencias de ADN (o cualquier combinación de secuencia y seguimiento de ABI), con la alineación hipervínculizada a la secuencia original encuentra sitios de restricción silenciosa translacionalmente Dibuja mapas de ORF gráficos

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