Msatcommander Localice las repeticiones de microsatélite, diseñe cebadores específicos de locus y etiquete ellas
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Msatcommander Clasificación y resumen

Msatcommander Etiquetas

repetir diseño de imprimación cebador repeticiones biológicas ADN microsatélite Finder de repetición de microsatélite imprimación de etiquetas microsatélite Locus de susceptibilidad de la enfermedad Conjunto de datos de microsatélite grande analizador de microsatélite encuentra anidado en tándem repite encontrar marcadores de microsatélites Buscador de marcadores de microsatélite Primers de diseño Detecte repeticiones de ADN DNA repite la detección

Msatcommander Descripción

Msatcommander es un programa de Python escrito para localizar Microsatellite (SSR, VNTR, C) se repite dentro de la secuencia formateada por FASTA o los archivos de consenso. MSATFinder buscará todas las repeticiones de DI, TRI-, TETRA-, PENTA- y HEXA-nucleótidos (con opciones para buscar menos tipos de repetición y combinaciones de tipos de repetición). ¡Dale a Msatcommander un intento de evaluar completamente sus capacidades! Principales características: busca todas las repeticiones de mono-, di-, tri-, tetra-, penta y hexanucleótidos Las repeticiones pueden combinarse a través de distancias especificadas por el usuario (BP) Disee los cebadores para las repeticiones ubicadas Etiquetas y pruebas cebadoras con M13R, CAG o TAG personalizada. El cebador 'mejor' se informa al usuario Agrega GTTT PIGTAILS a la imprimación sin etiquetar, 'BEST' informada al usuario ofrece una GUI conveniente para la mayoría de los usuarios Las salidas producen resultados en formato CSV, para facilitar la importación al software de hoja de cálculo

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