Satélito inferencia de haplotipo de datos SNP inconfugiados en polloides heterocigotos basados en SAT
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Satélito Descripción

Satlotyper es una herramienta de software diseñada para inferir haplotipos de datos SNP Polypoid y Polyallelic Infasionados. Satlotyper utiliza operadores y variables booleanos para formular inferencia de haplotipos por pura parsimonia (HIPP) para el problema de la satisfacción booleana (SAT). Para encontrar el conjunto más parsimonioso de explicar haplotipos, Satlotyper comienza con suponer que se explica el haplotipo y aumenta el número de haplotipos hasta que se encuentra un conjunto satisfactorio. Dado que SAT es NP-Complete, no se puede garantizar que se encuentra una solución en un tiempo razonable para obtener datos determinados. Sin embargo, las pruebas empíricas mostraron que es posible calcular inferencias para los datos del mundo real. Además, Satlotyper proporciona restricciones para explicar soluciones alternativas y es capaz de optimizar la probabilidad del resultado por medio de un procedimiento de arranque. ¡Dale a Satlotyper un intento de ver qué tan útil puede ser para ti!

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