Vista marítima Esta aplicación es capaz de leer y escribir varios formatos de alineación.
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Vista marítima Clasificación y resumen

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Leer secuencia alineación del texto Leer formatos de alineación editor de alineación gráfica Escribir formatos de alineación alineación Aplicación de escritura crear alineación Alineación de documentos Visualización de alineación manipular la alineación manipulación de alineación precisión de alineación Alineación de proteínas Alineación múltiple editor de alineación Método de alineación Mostrar alineación Alineación empalmada Análisis de alineación por pares Analizar la alineación de la pareja Ver archivo de alineación mostrar archivo de alineación análisis de alineación alineación de la página

Vista marítima Descripción

Seaview es una aplicación de software diseñada específicamente para ayudarlo a estudiar y analizar las alineaciones de la secuencia, así como la filogenia molecular. Integra habilidades para leer y escribir varios formatos de archivo, como Nexus, MSF, Clustal, FastA, Phylip, Mase y Newick. Packagethis portátil es un programa independiente que se puede ejecutar directamente en su computadora sin instalarse de una manera que altera la información de configuración del Registro de Windows. Puede almacenar la utilidad en cualquier dispositivo de almacenamiento, como las unidades flash USB. La mejor parte cuando está utilizando herramientas portátiles es que no necesita privilegios de administrador para ejecutar los programas, ya que no dejan archivos o configuraciones en la computadora host. INTERFERDOUCHO DE USUARIO La GUI no impresiona mucho en el departamento visual, en realidad es práctico y fácil de trabajar. El soporte de arrastrar y soltar también está en la lista de características para que pueda importar datos rápidamente desde un archivo externo. Puede hacer uso de atajos de teclado para explorar datos o presione los clics del mouse para seleccionar elementos y mover secuencias seleccionadas a otro lugar en una alineación. La herramienta también se puede ejecutar utilizando la línea de comandos. Importación / exportación de optioSide desde los formatos de archivo compatibles que se han enumerado en la introducción, puede agregar información de varias bases de datos, como EMBL, GenBank y Swissprot / Uniprot. Además, puede guardar la alineación en el archivo actual o exportar datos a un archivo, guardar la alineación en el formato de archivo PDF (se le da la libertad de alterar el tamaño de la fuente, el bloque y el papel, cambiar el color y la salida solo los sitios variables de la alineación y sus posiciones). Se le permite agregar una alineación al final de otro por nombre o rango. Las características de edición y las opciones de alineación) lo ofrece la posibilidad de copiar las secuencias seleccionadas al portapapeles, pegar datos de alineación del portapapeles, seleccione todas las secuencias de la alineación, cambie el nombre de la secuencia seleccionada actualmente, edite los comentarios, así como alterar una secuencia al pegar la secuencia externa Datos o abriendo dos paneles de secuencia de edición y transfiriendo información entre ellos. Otras tareas útiles que se pueden aplicar a las secuencias se refieren a eliminar, crear y cargarlas. Además, puede duplicarlos y revertirlos, realice un análisis de la parcela de puntos, elimine todos los sitios de separación de la alineación y configure el código genético para traducir a proteína la (s) secuencia (s) seleccionada (s). Cuando se trata de acciones que lo ayudan a administrar las alineaciones, puede ejecutar la alineación de destino en todas las secuencias y secuencias seleccionadas, sitios seleccionados o un perfil (más específicamente un grupo de secuencias pre-alineadas). Configuraciones de configuración y otras herramientas poderosas. Vista le permite configurar el tamaño de fuente utilizado para mostrar las secuencias, visualizar las secuencias de ADN como las proteínas, use las reglas de color para definir las secuencias de proteínas, generan estadísticas sobre las composiciones de la secuencia de base o de aminoácidos, las composiciones de transición y transversión, especifiquen el Partes de una alineación múltiple que se almacenarán para un análisis adicional, cree y almacene conjuntos de especies si se usa el formato MASE o NEXUS, inserte las líneas de comentarios en la parte inferior de la pantalla y realice las búsquedas. Además, puede calcular, dibujar, importar y guardar árboles filogenéticos de ADN o proteínas, parcela, guardar impresión y copiar árboles filogenéticos, y realice un análisis de 'parcela de puntos' de dos secuencias. Línea de fondo En general, SeaView demuestra ser un programa avanzado para la alineación de la secuencia múltiple y la filogenia molecular, y es adecuada especialmente para los usuarios de energía. Revisado por Ana Marculzescu, Última actualización el 26 de septiembre de 2014

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