AMÉN Amén es un conjunto unificado de herramientas para administrar, explorar y combinar datos biológicos de alto rendimiento multifacético.
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AMÉN Clasificación y resumen

AMÉN Etiquetas

cartografía gestionar datos biológicos explorar datos biológicos Ubicación cromosómica biológico cromosómico

AMÉN Descripción

Amén es un conjunto unificado de herramientas para administrar, explorar y combinar datos biológicos de alto rendimiento multifacético. Amén significa anotación, asignación, expresión y red y es una suite de herramientas unificadas independiente para administrar, explorar y combinar datos biológicos de alto rendimiento multifacético, como anotación, ubicación cromosómica, expresión y datos de interacción. Requisitos: · TCL / TK ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: 7 módulos: · Módulo para estimar si una entidad biológica (proteína para exemple) interactúa o regula más genes / proteínas en un grupo de genes en comparación con los genes completos (enriquecimiento en redes regulatorias o de interacción). Escrito por Aurélie Lardenois. · Módulo para visualizar estos enriquecimientos como una red. Escrito por Aurélie Lardenois. · Dos módulos para k-Medios K-Semi-supervisados ​​y métodos PAM. · Módulo para agregar archivos de ajuste de genes (archivos .gmt de GSEA) al archivo de anotación. · Módulo para normalizar con genes de control positivo o negativo. · Módulo para reorganizar las muestras en un archivo de expresión Dos cambios: · Al importar archivos de grupo, ahora están ordenados en el orden alfabético y luego se importan en Amén · Se modificó el módulo de instalación de paquetes R.

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