BIO :: Herramientas :: Blplite :: HSP BIO :: Herramientas :: BLPLITE :: HSP es una explosión de pares de puntuación alta (HSP).
Descargar ahora

BIO :: Herramientas :: Blplite :: HSP Clasificación y resumen

BIO :: Herramientas :: Blplite :: HSP Etiquetas

Módulo perl puntuación bioperl informar Puntuación Récord Par Hsp

BIO :: Herramientas :: Blplite :: HSP Descripción

BIO :: Herramientas :: BLPLITE :: HSP es una explosión de pares de puntuación alta (HSP). BIO :: Herramientas :: BLPLITE :: HSP es una explosión de reporte de alta puntuación (HSP) .Synopsis Use BIO :: Herramientas :: Bllite; My $ Informe = New Bio :: Herramientas :: Blplite (-fh => * stdin); {MIENTRAS (MIS $ SBJCT = $ INFORME-> NEXTSBJCT) {MIENTRAS (MIS $ HSP = $ SBJCT-> NEXTHSP) {$ HSP-> puntuación; $ hsp-> bits; $ hsp-> porcentaje; $ hsp-> p; $ HSP-> Partido; $ hsp-> positivo; $ HSP-> Longitud; $ hsp-> queryseq; $ HSP-> SBJCTSEQ; $ hsp-> homologyseq; $ hsp-> consulta-> inicio; $ hsp-> query-> final; $ HSP-> HIT-> Inicio; $ HSP-> HIT-> FIN; $ HSP-> HIT-> SEQ_ID; $ hsp-> hit-> superposos ($ exón); }} # La siguiente línea lo lleva al siguiente informe en la secuencia / archivo # devolverá 0 si ese informe está vacío, # pero es válido para un informe vacío. # Devuelve -1 para EOF. Último IF $ Informe -> _ parseheader == -1; rehacer} Este objeto maneja los datos del par de alta puntuación para un informe de explosión. Aquí es donde se almacena el porcentaje de identidad, consulta y se golpean la longitud de la secuencia, el valor de P, etc., donde la mayor parte de la información necesaria se encuentra al crear la lógica al analizar un informe de explosión. Requisitos: · Perl

BIO :: Herramientas :: Blplite :: HSP Software relacionado