Bio :: Alignio :: MSF BIO :: Alignio :: MSF es un módulo PERL con la secuencia de la secuencia MSF.
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Bio :: Alignio :: MSF Clasificación y resumen

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Módulo perl secuencia flujo de entrada / salida secuencia msf MSF

Bio :: Alignio :: MSF Descripción

BIO :: Alignio :: MSF es un módulo PERL con la secuencia de la secuencia de MSF / Stream de salida. Bio :: Alignio :: MSF es un módulo PERL con Secuencia MSF, entrada / salida Stream.SynopsisDO, no use este módulo directamente. Úselo a través de la clase BIO :: Alignio Class.Este objeto puede transformar Bio :: Alinear :: Aligni Objetos hacia y desde las bases de datos de archivos planos de MSF. El resto de la documentación detalla cada uno de los métodos objeto. Los métodos internos generalmente se precedan con un _next_alntitle: next_alnusage: $ aln = $ stream-> next_aln () Función: Devuelve la siguiente alineación en el flujo. Intenta leer * Todos * MSF Lee todos los caracteres que no son espacios en blanco en el área de alineación. Para MSFS con huecos raros (por ejemplo, ~~~) mapelos usando $ AL-> MAP_CHARS ('~', '-') devuelve: l objetos: nowrite_alntitle: write_alnusage: $ stream- > Función de escritura_aln (@aln): escribe el objeto $ ALN en el tipo de secuencia de formato MSF de la alineación se determina mediante la primera secuencia. Duración: 1 para el éxito y 0 para los errores: l Requisitos de objeto: · Perl

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