Bio :: Das :: Lite BIO :: DAS :: Lite es una extensión Perl para el protocolo DAS (HTTP XML).
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Bio :: Das :: Lite Descripción

BIO :: DAS :: Lite es una extensión Perl para el protocolo DAS (HTTP XML). Bio :: Das :: Lite es una extensión Perl para el protocolo DAS (HTTP XML ).Synopsis Use BIO :: DAS :: Lite; My $ bdl = bio :: das :: lite-> new_from_registry ({'Categoría' => 'cromosoma'}); My $ resultados = $ bdl-> características ('22 '); SUBROUTINAS / MODIFICOSNEW: CONSTRUCTOR MY $ DAS = BIO :: DAS :: Lite-> Nuevo (' http://das.ensembl.org/das/ensembl1834 ' ) My $ DAS = BIO :: DAS :: Lite-> Nuevo ({'Tiempo de tiempo' => 60, 'DSN' => 'http: // usuario: pass@das.ensembl.org/das/ensembl1834', 'http_proxy '=>' http: // Usuario: pass@webcache.local.com: 3128 / ',}); Las opciones pueden ser: DSN (SCALAR OPCIONAL REF, URLS de los servicios de DAS) Tiempo de espera (Opcional Int, HTTP Fetch Timeout en segundos) http_proxy (escalar opcional, caché web o proxy si no se establece en el almacenamiento en caché de% ENV) (BOOL opcional, primitiva CallBack On / Off) Callback (código de código opcional, devolución de llamada para bloques XML procesados) Registro (Array Ref opcional que contiene DAS Registry Service URLS por defecto en 'http://das.sanger.ac.uk/registry/services/das') proxy_user (Scalar opcional, nombre de usuario para autenticar el proxy hacia adelante) Proxy_pass (Scalar opcional Scalar, contraseña para autenticar el proxy hacia adelante) User_agent (Valor opcional Scalar, Agente de usuario de la solicitud HTTP-HTTP) New_from_registry: constructor similar a "nuevo" arriba, pero es compatible con las capacidades " y 'Categoría' en el hashref dado, usándolos para consultar el registro DAS y configurar los DSN en consecuencia. My $ das = bio :: das :: lite-> new_from_registry ({'capacidades' => , 'Categoría' => ,}); Las opciones son las anteriores, más Capacidad de Capacidad (Arrayref de Capacidades opcionales) Categoría (Opcional Arrayref of Categorías) Requisitos: · Perl · LWP :: Parallel :: UserAgent · Http :: solicitudes · HTTP :: encabezados · Jabón :: Lite · Carpa

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