Bio :: Gráficos :: Feupfile

BIO :: Graphics :: featurefile es un conjunto de características de Bio :: Gráficos, almacenados en un archivo.
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Bio :: Gráficos :: Feupfile Clasificación y resumen

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  • Rating:
  • Licencia:
  • Perl Artistic License
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  • FREE
  • Nombre del editor:
  • Lincoln Stein
  • Sitio web del editor:
  • http://search.cpan.org/~lds/Crypt-CBC-2.29/CBC.pm

Bio :: Gráficos :: Feupfile Etiquetas


Bio :: Gráficos :: Feupfile Descripción

BIO :: Gráficos :: Fareepfile es un conjunto de características de Bio :: Gráficos, almacenados en un archivo. Bio :: gráficos :: featurefile es un conjunto de características de Bio :: Gráficos, almacenados en un archivo.Synopsis Use BIO :: Gráficos :: FileFile; My $ DATA = BIO :: Gráficos :: Feupfile-> Nuevo (-File => 'Fareads.txt'); # Crear un nuevo panel y representa los contenidos del archivo en él My $ Panel = $ Data-> New_Panel; My $ Tracks_Rendered = $ Data-> Render ($ panel); # o hazlo todo en un solo paso mi ($ tracks_rendered, $ panel) = $ DATA-> Render; # Para obtener más control, haz clic en las pistas individualmente mi @feature_types = $ data-> tipos; Para mi tipo $ (@feature_types) {mis características de My $ = $ DATA-> Características ($ Tipo); MI% Opciones = $ DATOS-> Estilo ($ tipo); $ Panel-> Add_Track ($ características,% opciones); # asumiendo que tenemos una biografía :: gráficos :: panel} # Obtenga configuraciones individuales My $ EST_FG_COLOR = $ DATA-> Configuración (EST => 'FGCOLOR'); # o cree el archivo de características a mano # Añadir un tipo $ DATA-> ADD_TYPE (EST => {FGCOLOR => 'azul', altura => 12}); # Añadir una característica My $ Feature = Bio :: Graphics :: Feature-> Nuevo (# Params); # O algunos otros datos de SEQi $-> Add_Feature ($ Feature => 'est'); The Bio :: Graphics :: FareFile Module lee y analiza archivos que describen las características de secuencia y sus representaciones. Acepta tanto el formato GFF como un formato de archivo más fácil de humanos que se describe a continuación. Una vez que se ha inicializado un objeto FareFile, puede interrogarlo por sus características componentes y su configuración, o representa todo el archivo en una biografía :: gráficos :: panel. Este moduel es un precursor de la biografía de Jason Stajich :: Annotation :: Collection Clase, y cumple una función similar al almacenar una colección de características de secuencia. Sin embargo, también almacena la información que representa sobre las características, y actualmente no sigue la interfaz Collectioni. Requisitos: · Perl


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