Bio :: Herramientas :: Ejecutar :: Pisaplication :: Align2Model

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Bio :: Herramientas :: Ejecutar :: Pisaplication :: Align2Model Clasificación y resumen

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  • Rating:
  • Licencia:
  • Perl Artistic License
  • Precio:
  • FREE
  • Nombre del editor:
  • Catherine Letondal
  • Sitio web del editor:
  • http://search.cpan.org/~birney/bioperl-run-1.4/Bio/Tools/Run/PiseApplication/fasta.pm

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Bio :: Herramientas :: Ejecutar :: Pisaplication :: Align2Model Descripción

Bio :: Herramientas :: Ejecutar :: Pisapplication :: Align2Model es una clase Bioperl para Align2Model: cree una alineación múltiple de secuencias ... BIO :: Herramientas :: Ejecutar :: Pisapplication :: Align2Model es una clase bioperl para Align2Model: cree una alineación múltiple de secuencias a un modelo existente. Parámenes: Align2Model (STRING) Ejecute (cadena) Ejecute DB (Secuencia) Secuencias para alinear (-DB) Modelo_file (infile) Modelo (-i) TUBO: SAM_MODEL IDENTIFICACIÓN (STRING) Identificador (s) de secuencia (Separado por comas) (-id) NSCORESEQ (INTEGER) Número máximo de secuencias para leer (-nsscoreseq) Adpstyle (excepto) Estilo de programación dinámica (-Apstyle SW (excl) Secuencia de puntuación (-SW) AUTO_FIM (Interruptor) Agregue FIMS automáticamente (-Auto_FIM) Jump_in_PROB (Float) Costo de probabilidad de saltar en el centro del modelo (-jump_in_prob) jump_out_prob (Flotando) Costo de probabilidad de saltar por el centro del modelo (-JUGM_OUT_PROB) A2MDots (conmutador) Imprimir puntos para llenar la necesidad de espacio para las inserciones de otras secuencias (-A2MDots) dump_parameters (excl) (-dump_parameters) Requisitos: · Perl


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