Bio :: SEC :: SEQWITHQUALIDAD BIO :: SEQ :: seqwithquality es un objeto bioperl que envasa una secuencia con su calidad.
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Módulo perl objeto secuencia bioperl Objeto bioperl empaquetado de secuencia

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Bio :: Seq :: SeqWithQuity es un objeto Bioperl que envasa una secuencia con su calidad. Bio :: seq :: seqwithquality es un objeto bioperl que envasa una secuencia con su calidad. HSYNOPSIS Use BIO :: PRIMERSEQ; Use BIO :: SEQ :: PRISTALQUAL; # Hacer de la memoria My $ qual = bio :: seq :: seqwithality-> nuevo (-qual => '102030405050502010 ', -SEQ =>' atcgatcg ', -id =>' Human_id ', -Accession_Number => 'al000012',); # Hacer de los objetos # Primero, hacer un objeto PRIMERSEQ MY $ SEQOBJ = BIO :: PRIMERSEQ-> NUEVO (-SEQ => 'atcgatcg', -id => 'genefragment-12', -accession_number => 'x78121', - alfabeto => 'ADN'); # ahora haga un objeto primario My $ qualobj = bio :: seq :: primeroqual-> nuevo (-qual => '1020304050502010 ', -id =>' genefragment-12 ', -accession_number => 'X78121', -alphabet => 'ADN'); # Ahora haga el objeto SECWIPHQUALDY MY $ SWQOBJ = BIO :: SEQ :: seqwithquality-> New (-SEQ => $ SEQOBJ, -QUAL => $ QualOBJ); # ¡hecho! $ swqobj-> id (); # El ID del objeto SECWITHQUALY # puede no coincidir con el ID de la secuencia o el # de la calidad (verifique el pod, Luke) $ SWQOBJ-> SEQ (); # la secuencia del objeto seqwithquality $ SWQOBJ-> QUAL (); # la calidad del objeto de SecwithQuity # para sacar partes de la secuencia. Imprimir "SECUENCIA", $ SEQOBJ-> ID (), "con la adhesión", $ SEQOBJ-> ADQUIESIÓN, "Y DESC", $ SEQOBJ-> DESC, "N"; $ string2 = $ SEQOBJ-> SUBSEQ (1,40); Requisitos: · Perl

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