Bio :: Seqio :: FASTA BIO :: SEQO :: FASTA es un módulo PERL con secuencia de entrada / salida de secuencia FASTA.
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Bio :: Seqio :: FASTA Clasificación y resumen

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Módulo perl secuencia Secuencia FASTA fastaja bioperl flujo de salida

Bio :: Seqio :: FASTA Descripción

BIO :: SEQIO :: FASTA es un módulo PERL con secuencia de entrada / salida de secuencia FASTA. BIO :: SEQO :: FASTA es un módulo Perl con Secuencia FASTA Secuencia de entrada / Stream.ApMendixEl resto de la documentación detalla cada uno de los métodos objeto. Los métodos internos generalmente se precedan con un título _next_seq: next_seq uso: $ SEQ = $ STREAM-> NEXT_SEQ () Función: Devuelve la siguiente secuencia en la secuencia Devoluciones: Bio :: SEC OBJETO ARGS: NOWRITE_SEQ Título: Write_seq Uso: $ Stream- > Función de escritura_seq (@SEQ): escribe el objeto de $ SEQ en los retornos de la secuencia: 1 para el éxito y 0 para ERROR ARGS: ARRAY DE 1 A N BIO :: PRIMERSEQUESSSWIDTH Título: Ancho Uso: $ obj-> Ancho ($ NEWVAL Función: Obtener / configurar el ancho de línea para la salida FASTA Retorno: Valor del ancho Args: NewValue (opcional) PreferRed_ID_Type Título: PreferRed_ID_Type Uso: $ obj-> Función preferida_id_type ('Adhesión') Función: Obtener / establecer el tipo preferido de identificador para Use en la posición "> ID" para la salida FASTA. Devoluciones: cadena, uno de los valores definidos en @bio :: seqio :: FASTA :: SEQ_ID_TYPES. Predeterminado = $ BIO :: SEQO :: FASTA :: DEFAULT_SEAQ_ID_TYPE ('PANTALLA'). Args: cadena al configurar. Este debe ser uno de los valores definidos en @bio :: seqio :: FASTA :: SEQ_ID_TYPES. Valores permitidos: adhesión, accession.version, pantalla, tiros primarios: excepción fatal Si el tipo de identificación suministrado no está en @seq_id_types. Requisitos: · Perl

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