 | CaínSimulaciones estocásticas para cinética química |
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Caín Descripción
Simulaciones estocásticas para cinética química. Caín es capaz de realizar simulaciones estocásticas y deterministas de diferentes reacciones químicas. Puede generar múltiples procesos de simulación para utilizar computadoras de múltiples núcleos. Almacena los modelos, los parámetros de simulación y los resultados de la simulación en un formato XML. Además, los modelos SBML pueden ser importados y exportados. Los modelos y los parámetros de simulación se pueden leer a partir de archivos de entrada o editarlos dentro del programa. La GUI (interfaz de usuario gráfica) está escrita en Python y utiliza el kit de herramientas WXPYPHON. Los solversos se implementan como ejecutables de línea de comandos, escritos en C ++, que son impulsados por Caín. Esto hace que sea fácil lanzar trabajos por lotes. También simplifica el proceso de agregar nuevos solversos. Caín ofrece una variedad de solucionadores: - método directo de Gillespie.- El primer método de reacción de Gillespie.- Gibson y el siguiente método de reacción de Gibson y Bruck.- Tau-saltando.- Híbrido directo / tau-saltando.- Integración de oda. ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: · Documentación mejorada. · Silverses simples para problemas inhomogéneos al tiempo. · Soluciones de histogramas que ahora registran la media y la varianza. · Mejora de la programación de empleo. · Formatos de archivo mejorados. · Refactorización para ayudar al desarrollo futuro.
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