| Color de malva Construye alineaciones múltiples globales de secuencias del genoma reorganizado |
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Color de malva Clasificación y resumen
- Nombre del editor:
- Aaron Darling
- Sitio web del editor:
- http://www.cs.wisc.edu/~darling/libgenome/
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Color de malva Descripción
Construye alineaciones múltiples globales de secuencias del genoma reorganizado. El Proyecto Malve es un sistema para construir de manera eficiente múltiples alineaciones genomas en presencia de eventos evolutivos a gran escala, como la reorganización y la inversión. La alineación del genoma de los múltiples proporciona una base para la investigación en genómica comparativa y el estudio de la dinámica evolutiva. Alinear los genomas enteros es un problema fundamentalmente diferente que al alinear las secuencias cortas. Se ha desarrollado la idea de que un alineador de múltiples genomas debe requerir solo recursos computacionales modestos. Emplea las técnicas algorítmicas que se escalan bien en la cantidad de secuencia alineadas. Por ejemplo, un par de genomas de y. Pestis se puede alinear en menos de un minuto, mientras que un grupo de 9 genomas enterobacterianos divergentes se puede alinear en unas pocas horas.
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