 | CynoteCuaderno de laboratorio cibernético para biólogos y bioinformaticistas |
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Cynote Descripción
Cuaderno de laboratorio cibernético para biólogos y bioinformaticistas. Cynote es un cuaderno de laboratorio que utiliza el sistema de control de versiones para copias de seguridad y estampado de fecha de fecha independiente (que puede ser una forma de notarización), con el fin de garantizar la responsabilidad del registro y la auditoría. El proyecto de investigación hoy en día se ha basado en numerosos documentos digitales en los formularios. De las imágenes y los correos electrónicos de discusión para nombrar algunos. No es raro encontrar cientos de documentos digitales relacionados con el trabajo de investigación dentro de un mes de investigación biológica activa y la gestión de estos datos generan un nuevo conjunto de problemas para los biólogos: * Los datos generados pueden ser demasiado voluminosos para imprimir (como en el caso de Resultados de Microarray) * Múltiples imágenes similares, que pueden ser difíciles de realizar un seguimiento (a menudo referencias cruzadas a las condiciones experimentales reales escritas en los cuadernos físicos) * Los datos multimedia, como los videos, la microscopía lapsizada por el tiempo, son imposibles de imprimir. * Autenticidad de Datos digitales para presentaciones de propiedad intelectual. * Cuestiones de gestión de datos de usos ad hoc de bases de datos externas como PubMed. Actualmente, no hay medios y prácticas estándar para el mantenimiento de registros de investigación electrónica; Por lo tanto, muchas políticas institucionales aún requieren documentos digitales cruciales (imágenes, correos electrónicos, etc.) que se impriman, se colocan en cuadernos físicos, fechados y contrarrestados (testigos de entradas por parte de una persona independiente). La razón principal es que "los archivos de computadora no proporcionan evidencia suficiente de invención. La razón para tener registros de invención, como un portátil, es poder demostrar la fecha de la invención. Dado que los registros de la computadora se pueden actualizar y cambiar a voluntad, y Sus fechas están sujetas a manipulaciones, no pueden servir como evidencia de que su contenido se creó en un momento determinado. Con un cuaderno encuadernado, está claro que el trabajo ocurrió en una secuencia particular y fue presenciado por otros. Además, los experimentos científicos pueden ser Realizado en la tinta y el papel en un cuaderno para demostrar su edad ". (Adaptado de la Escuela de Ingeniería y Ciencia, Instituto de Tecnología de Stevens) Sin embargo, esto no es infalible, ya que la pérdida de cuadernos físicos a través del robo y la mala colocación no es inaudita. También debe tenerse en cuenta que algunos factores pueden reducir el valor o la credibilidad de su cuaderno de laboratorio: * Las entradas ilegibles son totalmente inútiles; * Las páginas sin firmar o sindical son casi totalmente inútiles; * Las páginas de cuaderno que no se han presenciado son casi tan malas como las páginas sin firmar e intactas; * un largo retraso entre la firma de la página por el Inventor y el testigo plantea preguntas; * Páginas de portátiles consecutivas que no están fechadas en las preguntas de planteo de orden cronológico; * Faltan las páginas de los cuadernos plantean las preguntas; * Los borrados y las eliminaciones plantean preguntas, en cambio, cualquier error descubierto posterior debe corregirse y explicarse en la siguiente Página en blanco disponible, haciendo referencia a la página con el error. Cynote apunta a ser un sistema de gestión de registros de investigación electrónica que se ajuste a los estándares de mantenimiento de registros de cuadernos físicos basados en 3 principios: 1. Los cuadernos se pueden configurar para el cifrado y la copia de seguridad de rutina en centros de datos garantizados (como Amazon S3) 2. El estampado de notas de fecha de los cuadernos se realiza mediante sistemas remotos (sello inmediato de fecha de fecha en la carga) 3. Las ediciones de la página son generalmente rechazadas. Sin embargo, si las ediciones de la página se realizan con fuerza, se rastreará y se sellará la fecha de fecha utilizando los sistemas de administración de código fuente (como la subversión) al mismo tiempo, las herramientas de investigación se pueden desarrollar como complementos en Cynote y los registros se pueden rastrear de inmediato; Por lo tanto, al guardar el esfuerzo en transponer datos a través de sistemas.developer Comentarios en mi caso, estoy desarrollando cynote como una herramienta de enseñanza para mis clases de bioinformática donde puedo incorporar algunas funciones de bioinformática y análisis de datos comunes, así como una herramienta de gestión de datos de laboratorio. Para mí y para mis alumnos. Requisitos: · Python ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: · Método para optimizar la actualización de Cynote y el web2py subyacente. · Registro para la creación de nuevos cuadernos, entradas y comentarios.
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