En perl Módulos PERL para ontologías oboformateadas
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Módulo perl perla ontologías

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En Perl una colección de módulos PERL para tratar con ontologías oboformateadas (como la ontología del gen). Esta distribución de código reúne módulos orientados a objetos (para manejar elementos de ontología, como un término, una relación, un sinónimo, y así sucesivamente), scripts (para tareas típicas, como las conversiones de formato: OBO2OWL, OWL2OBO; Además, también hay muchos ejemplos que se puede adaptar fácilmente para aplicaciones específicas), y un conjunto completo de archivos de prueba para garantizar su calidad de implementación. Citando a PERL: Si usa en Perl en su trabajo, se le solicita amablemente que cite: a-Perl: An API que apoya el desarrollo y análisis de las bio-ontologías E. antezana; M. EGANA; B. De Baets; M. Kuiper; V. Mironov Bioinformatics 2008; DOI: 10.1093 / BioInformática / BTN042SEEEEE: 1. Perldoc en PERL.POD 2. En Toolkit: un conjunto de herramientas de galaxia para lidiar con las ontologías oboformateadas, Antezana E, Venkatesan A, Mungall C, Mironov V, Kuiper M . BMC Bioinformática 2010, 11 (Suppl 12): S8 DOI: 10.1186 / 1471-2105-11-S12-S8Files IN a-PERL: Readme Readme Archivo Instale cómo instalar la licencia de PERL (Requisitos) en la licencia de PERL en PERL-XYTAR.GZ A-PERP API: Versión XY (archivo GZIP) Cambia la descripción sobre los cambios en el perlemark: A-PERL se proporciona "As-Is". La versión actual es estable; No obstante, se esperan mejoras, así como la retroalimentación es muy bienvenida. Visite constantemente este repositorio para verificar las versiones actualizadas de esta página principal de distribución.

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