Enriquecer Análisis funcional de proteínas mediante enriquecimiento y agotamiento de variantes
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análisis proteína secuencia secuencia de proteínas Análisis de proteínas Variantes de ADN

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Análisis funcional de proteínas por enriquecimiento y agotamiento de variantes. Enrich es una herramienta de Python para analizar los datos de secuenciación de alto rendimiento de un par de bibliotecas no seleccionadas y seleccionadas para crear estimaciones de acondicionamiento físico para las variantes de proteínas o de ADN en cada biblioteca. El hogar (análisis funcional de proteínas mediante enriquecimiento y agotamiento de variantes) es una tubería de análisis para usar Datos de secuenciación de alto rendimiento para evaluar las relaciones de la función de la secuencia de proteínas. Enriquecerá los archivos Fastq como entrada, traducir e identificar secuencias de proteínas únicas y calcular los índices de enriquecimiento entre las bibliotecas para cada secuencia. Enrich, se puede ejecutar desde la línea de comandos o en un modo interactivo, y es capaz de usar datos de lectura de extremo pareado. Cada paso de la tubería se puede ejecutar por separado o toda la secuencia de pasos se puede ejecutar consecutivamente. Enrich, emplea a DrmaA en paralelo a las tareas que consumen tiempo. Para obtener una descripción de la entrada, la función y la salida de ENRICH, consulte las siguientes publicaciones: Mapeo de alta resolución de las relaciones de la función de secuencia de proteínas. Fowler DM, Araya Cl, Fleishman SJ, Kellogg EH, Stephany JJ, Baker D, Fields Methods Nat. 2010 sep; 7 (9): 741-6. EPUB 201015 de agosto. Escaneo mutacional profundo: evaluación de la función de proteína en una escala masiva. Araya cl, fowler dm. Tendencias Biotechnol. 2011 de 9. Análisis funcional de proteínas mediante enriquecimiento y agotamiento de variantes (enriquecido). Fowler DM, Araya Cl, Fields S. Manuscrito en la preparación (correo electrónico D. Fowler para una copia) .DocumentationLead La documentaciónIntallationEnrich se instala utilizando el módulo Easy_Install, que forma parte de SetuptOols. Consulte la documentación para obtener instrucciones sobre cómo usar Easy_Install para instalar Enrich. Requisitos: · Python

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