Filógrafo Filógrafo es un programa diseñado para visualizar y estudiar relaciones evolutivas dentro de las familias de genes homólogos.
Descargar ahora

Filógrafo Clasificación y resumen

Filógrafo Etiquetas

colocar generador de graficos genes homólogos proteínas homólogas homólogo genes

Filógrafo Descripción

El filoógrafo es un programa diseñado para visualizar y estudiar relaciones evolutivas dentro de las familias de genes homólogos. El filoógrafo es un programa diseñado para visualizar y estudiar relaciones evolutivas dentro de las familias de genes o proteínas homólogas (elementos). El filograpógrafo es una herramienta de dibujo que genera gráficos personalizados para un conjunto determinado de elementos. En general, es posible utilizar el filografo para visualizar cualquier tipo de relaciones entre elementos. Cada gen o proteína en el gráfico del filografía se representa como un nodo de color (vértice) y conectado a otros nodos (vértices) por líneas (bordes) de grosor variable y color basado en la similitud de los genes o proteínas (Matriz de distancia). La posición de cada nodo en el gráfico es flexible y ajustada por el usuario para optimizar la visualización de las interrelaciones entre los nodos. En consecuencia, las distancias físicas en el gráfico entre nodos no tienen contenido de información a diferencia de los árboles filogenéticos clásicos. El nivel de similitud entre genes o proteínas en los gráficos del filografía se indica mediante el color y el grosor de línea. Filógrafo se escribe en TCL / TK y funciona en UNIX / Linux o Windows que admite el kit de herramientas TCL / TK. Las computadoras Macintosh pueden tener un problema en la ejecución del filografía debido al mouse de un solo botón. Las características críticas de los gráficos en general son los puntos relacionados con qué líneas. Los elementos básicos y las características de un gráfico son su: vértice (nodo), borde, Grado de un vértice (el número de bordes que lo tocan), tamaño (número de vértices), ruta (una ruta de vértice a vértice), longitud de la ruta (número de bordes en una ruta), gráficos planares y no planares (El gráfico es plano si se puede dibujar en un plano para que los bordes se intersecan solo en los vértices), distancia (ruta más corta), diámetro (distancia más larga entre dos vértices), vértice aislado (un vértice de grado cero), vértices adyacentes (conectado por un borde), vecindario (vértices adyacentes) y otros (puede verificar nuestra colección de enlaces web). Un árbol es un gráfico conectado que no contiene ciclos. Requisements: · TCL / TKWhat's NUEVO en esta versión: · La fijación de errores menor (filógrafa no funcionó correctamente si la identificación de genes representa solo en caracteres numéricos, por ejemplo, identificador de Genbank ).

Filógrafo Software relacionado