Flipdcd FlipDCD Invierte el endianismo de los archivos de trayectoria de dinámica Molecular DCD binarios.
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dinámica trayectoria Trayectoria de dinámica Flipdcd

Flipdcd Descripción

FlipDCD Invierte el endianismo de los archivos de trayectoria de dinámica Molecular DCD binarios. FlipDCD es una pequeña utilidad para revertir el endianismo de los archivos de trayectoria DCD binarios de Charmm, y NAMD. Esto puede ser útil cuando se ejecute simulaciones en una arquitectura y visualizar o analizar los resultados en otro.FixDCD es una utilidad diminuta para modificar el encabezado de un archivo DCD X-PLOR para que pueda legible por los programas que esperan los archivos DCD de Charmm, a expensas de Un valor de tamaño de TimeStep en el encabezado.FlipDCD proporciona un mecanismo para convertir el endianismo (ordenamiento de bytes) de los archivos de trayectoria de CHARMM, X-PLOR y NAMD DCD para que puedan cargarse mediante programas de visualización y análisis en plataformas con el pedido de bytes opuestos. de la plataforma en la que se generaron originalmente. Esto permite que uno use una PC con Windows para leer las trayectorias DCD generadas en un sol o un SGI y permite que un Sol o un SGI lean los archivos de trayectoria producidos en un clúster de PC que ejecuta Linux.flipdcd hace La conversión de endianess por memoria mapeando el archivo DCD con MMAP () y conversionando el endianismo en el lugar. Esto proporciona un método de rendimiento relativamente alto para realizar la conversión de endianess.flipdcd se puede usar para informar el estado de endian de los archivos DCD o para forzar una endia en particular sin tener en cuenta el origen de los archivos DCD.FlipDCD Uso: FlipDCD archivo. . . Donde "Archivo" puede ser una lista de archivos. El comportamiento predeterminado es voltear el pedido de bytes. Otras opciones son: -s Reportar el estado de pedido de bytes de cada archivo sin cambiarlo -b hacer / mantener cada archivo BIG-endian -l hacer / mantener cada archivo Little-Endian Las opciones son mutuamente excluyentes; La última lectura se usa. FixDCD cambia el encabezado en un archivo DCD de estilo X-Plor para que puedan ser leídos por las herramientas que esperan los archivos de trayectoria con formato de Charmm. Al igual que con FlipDCD, FixDCD realiza la conversión en el lugar. Esta conversión no es reversible, por lo que es posible que desee realizar una copia de seguridad de sus archivos (s).

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