Gabedit

GUI para Gaussian y Molpro.
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Gabedit Clasificación y resumen

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  • Rating:
  • Licencia:
  • BSD License
  • Precio:
  • FREE
  • Nombre del editor:
  • Allouche abdul-Rahman
  • Sitio web del editor:
  • http://lasim.univ-lyon1.fr/allouche/gabedit

Gabedit Etiquetas


Gabedit Descripción

GUI para Gaussian y Molpro. Gabedit es una interfaz de usuario gráfica de los paquetes de química computacional Gaussian, Molcas, Molpro y MPQC. Gabedit incluye instalaciones gráficas para generar palabras clave y opciones, especificaciones de la molécula y las secciones de entrada de entrada para incluso los tipos de cálculo más avanzados GABEDIT, incluye un constructor de molécula avanzada. Puede usarlo para dibujar rápidamente en moléculas y examinarlas en tres dimensiones. Puede construir moléculas por átomo, anillo, grupo, aminoácido y nucleósido. También puede leer la geometría desde un archivo. Se admiten la mayoría de los formatos de archivos moleculares mayores. Gabedit incluye una ventana de configuración de cálculo de Gaussian, Molcas, Molpro y MPQC que le permite configurar trabajos Gaussian, Molcas, Molpro y MPQC de una manera simple y directa. GABEDIT incluye un editor de texto para editar archivos de entrada Molcas, Molpro, Gaussian y MPQC. Gabedit puede mostrar gráficamente una variedad de resultados de cálculo de ADF Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC y (parcialmente), incluidos los siguientes: · Orbitales moleculares. · Superficies de la densidad electrónica, el potencial electrostático, la densidad de protección RMN y otras propiedades. · Las superficies se pueden mostrar en modos de malla de alambre sólidos, translúcidos y de alambre. · Las superficies pueden ser coloreadas por una propiedad separada. · Contornos (Color Codificado). · Planes (COLORCEDED). · Dipole · XYZ ejes y los ejes principales de la molécula. · Animación de los modos normales correspondientes a las frecuencias vibracionales. · Animación de la rotación de la geometría, la superficie, el dipolo, XYZ y los ejes principales de la molécula. · Animación de contornos. · Animación de aviones coloreados. Gabedit puede mostrar los espectros computados de IR y Raman. Gabedit puede generar un archivo POVRAY para la geometría (átomos + enlaces, incluido el enlace del hidrógeno), las superficies (incluidas las superficies coloreadas), los contornos, los planos coloreados. Gabedit puede guardar la imagen en formato PPM, BMP, (JPEG) y PS. Gabedit puede generar automáticamente una serie de imágenes para animación (vibración, convergencia de geometría, rotación, contornos, planos coloreados) Requisitos: · GTK + ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: · Se solucionaron errores menores. · Todos los cambios geométricos se pueden deshacer y rehacer utilizando el deshacer y el rehacer (U / U o Ctrl Z / Ctrl y) · El usuario tiene un control completo sobre los bonos que se muestran en un dibujo. · El dibujo del átomo de la molécula por átomo se ha simplificado. · El dibujo del fragmento de molécula por fragmento se ha simplificado. · GABEDIT leyó las conectidades de los archivos Gabedit, Hin, PDB, MOL2 y MOL. · El usuario puede establecer el valor de la distancia, ángulo de enlace y ángulo diótral. · Se implementa una búsqueda conformacional de dinámica molecular utilizando un potencial MM (Amber 99). · Se implementa una búsqueda de conformación de dinámica molecular utilizando un método semi-empírico (desde MOPAC o PCGAMESS abiertos). · Migración de funciones de dibujo de GDK a Cairo: Representación de dispositivos cruzados para gráficos vectoriales. · El Cairo ahora se usa para el widget XyPlot Gabedit (utilizado por Gabedit para spectrums Draw). · El Cairo ahora se usa para la ventana de dibujo de geometría. · La geometría se puede exportar en el archivo EPS, PS, PDF o SVG. · Las curvas de la ventana de XyPlot se pueden exportar en el archivo EPS, PS, PDF o SVG. · Nueva herramienta para calcular la distancia entre 2 puntos en la ventana de XyPlot. Se puede usar el botón "Control + Shift" para hacer un zoom en la ventana de XyPlot. · La nueva versión de PCGAMESS (Firefly) ahora es compatible


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