Genomorama: Visualización del genoma Genomorama: la visualización del genoma es un programa de visualización y análisis multi-escala, multi-genoma, visualización y análisis multiplataforma.
Descargar ahora

Genomorama: Visualización del genoma Clasificación y resumen

Genomorama: Visualización del genoma Etiquetas

visualización genoma programa de visualización Visualización del genoma programa de análisis Genomorama

Genomorama: Visualización del genoma Descripción

Genomorama: la visualización del genoma es un programa de visualización y análisis multi-scale, multi-genoma, multi-genoma. Genomorama: la visualización del genoma es un programa de visualización y análisis multi-scale, multi-genoma, multi-genoma. Proporciona una interfaz poderosa y fácil de usar que aprovecha la potencia de visualización de las computadoras modernas (a través de OpenGL) y la infraestructura bioinformática sustancial proporcionada por el NCBI (a través del kit de herramientas NCBI C). Genomorama está escrito en C ++ portátil, altamente optimizado y viene en tres "sabores" que le permiten que se ejecute de forma nativa (la mayoría) modernos sistemas operativos: OS X (usando carbono), Microsoft Windows (usando MFC) y Linux (usando Motif) . Los ejecutables y el código fuente se proporcionan libremente para todos los sabores. Aquí hay algunas características clave de "Genomorama Genome Visualization": · Alto rendimiento no se ha sacrificado en el altar de la portabilidad · OpenGL gráficos aproveche las tarjetas gráficas optimizadas de videojuegos disponibles en La mayoría de los computadoras de escritorio y portátil. · C ++ permite la utilización transparente y completa de los recursos del sistema (como la memoria). · Los kits de herramientas de ventanas nativas (carbono, MFC y MOTIF) para cada sistema operativo facilitan la capacidad de respuesta y la facilidad de uso. -Contenable Ejecutable Genomorama de la dependencia de las aplicaciones de terceros. · El código fuente para todas las plataformas está disponible gratuitamente. · Una interfaz de usuario con una atractiva y completa · Genomorama presenta una interfaz de usuario limpia y desaparecida. · Detección de múltiples escalas muestra detalles relevantes mientras se mantiene Lectura. · Use un teclado o un mouse para ampliar de manera eficiente, sartén y explore genomas de tamaño arbitrario. · Atractivo Postscript WYSIWYG y GIF OUT Poner formatos de calidad de la calidad de la publicación. · Características novedosas para ayudar a el análisis del genoma · Además de las opciones de búsqueda estándar (como la consulta por la secuencia y el nombre del gen), Genomorama ofrece búsquedas basadas en la hibridación de ADN de ADN. · Proporcionar un par de cebadores de PCR, y Genomorama emitirá los amplicones. · Proporcione una sonda de hibridación y Genomorama encontrará sitios vinculantes. · Proporcione un par de sondas de candado y Genomorama identificará ubicaciones de unión · Proporcione un conjunto de criterios de imprimación de PCR (longitud, temperatura de fusión, composición de base, etc.) y Genomorama encontrará PCR Los cebadores. parcelas (es decir,% g + c,% a + t, etc.). ¿Cuál es nuevo en esta versión: · Esta versión corrige los siguientes errores: analizando los archivos GBK que contienen anotaciones de base única en la cadena de complemento; · Partidas exactas perdidas a 3 'Fin de la secuencia de destino; · Análisis frágil del rango de anotación; · Descarga de registros muy grandes de GenBank (es decir, cromosomas humanos); · Y omitió el espacio intergénico siguiendo anotaciones de base única (es decir, SNPS). · Los registros de color personalizados ahora se guardan y leen de los archivos de GBK. · Se ha agregado un ejecutable de OS X específico de Intel. · El cuadro de diálogo Información ha sido realizado.

Genomorama: Visualización del genoma Software relacionado