Ghemical Ghemical es un paquete de modelado molecular con herramientas de GUI y visualización 3D.
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Ghemical Descripción

Ghemical es un paquete de modelado molecular con herramientas de GUI y visualización 3D. Ghemical es un paquete de software de química computacional publicado bajo la GNU GPL. Significa que el código fuente completo del paquete está disponible, y los usuarios son gratuitos para estudiar y modificar el paquete. El proyecto ghemical está escrito en C ++. El proyecto ghemical tiene una interfaz gráfica de usuario (que se basa en GNOME), y es compatible con los modelos de mecánicos cuánticos (semi-empíricos y abitricos) y modelos de mecánicos moleculares (hay un trato experimental de 5.2. Fuerza de campo para molecu orgánico También se incluye una herramienta para los modelos de proteínas reducidas . La optimización de la geometría, la dinámica molecular y un gran conjunto de herramientas de visualización están actualmente disponibles. Actualmente, se basa actualmente en el código externo para proporcionar los cálculos quantum-mecánicos. Semi-empírico Métodos MNDO, MINDO / 3, AM1 y PM3 provienen del paquete MOPAC7 (dominio público), y se incluyen en la distribución de origen. El paquete MPQC (GNU GPL) se utiliza para proporcionar métodos AB Initio: los métodos basados ​​en Hartree-Fock La teoría se admite actualmente con los conjuntos básicos que van desde STO-3G a 6-31G **. El código MPQC no está incluido en la distribución de origen. Para usar los métodos AB Initio AB basados ​​en MPQC en Ghemical, primero debe compilar e instalar el Programa MPQC para su sistema, y ​​luego compile ghemical utilizando algunas configuraciones específicas que vinculan los programas juntos; Consulte el archivo de instalación para obtener más información. Ghemical también contiene el paquete OpenBabel para la importación y la exportación de muchos formatos de archivo diferentes (así como otras tareas) .instalationOnce Ha descargado la última versión, debe extraer todos los archivos de su archivo de archivo usando "tar -zxvvf ghemical-1.00.tgz ghemical-1.00.tgz "o equivalentemente" Gunzip ghemical-1.00.tgz; tar -xvvf ghemical-1.00.tar ". Después de eso, lea la "instalación": el filo que acaba de extraer para obtener información adicional. Lo que está nuevo en esta versión: · Ghemical ahora se dirige hacia una nueva versión estable. · La versión actual es la versión recomendada para el uso "Producción". No es un lanzamiento estable oficial debido al recién agregado puerto WIN32, que aún necesita algunos toques finales antes de que todo funcione.

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