Grammy Abundancia relativa del genoma mediante modelos de mezcla
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Abundancia relativa del genoma utilizando modelos de mezcla Grammy es un módulo de Python que proporciona herramientas para la estimación de abundancia metagenómica basada en particiones de probabilidad de lectura (alineación o composición basada). Grammy es un marco computacional desarrollado para la abundancia relativa del genoma utilizando la estimación basada en la teoría del modelo de mezcla (grammy). La estimación precisa de la composición comunitaria microbiana basada en datos de secuenciación metagenómica es fundamental para el análisis de metagenomics. Los métodos de estimación prevalentes se basan principalmente en los resultados de alineación que resumen directamente o sus variantes; A menudo dan lugar a estimaciones sesgadas y / o inestables. Desarrollamos la abundancia relativa del genoma utilizando la teoría del modelo de la mezcla (Grammy) abordó la estimación del genoma La abundancia relativa de la relativa basada en la escopeta Se ha demostrado que se ha demostrado que se ha demostrado que las estimaciones son precisas y sólidas a través de conjuntos de datos de referencia de lectura real y reales. Requisitos: · Python

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