MQ2 tiene como objetivo extraer y encontrar qtls de la salida MAPQTL
Descargar ahora

MQ2 Clasificación y resumen

MQ2 Etiquetas

Biblioteca de Python Pitón

MQ2 Descripción

Módulo de Python Simple MQ2 para procesar la salida del análisis MAPQTL. ASIGURAR UNA QTL por grupo de enlace y usando el umbral de LOD establecido por el usuario. Esta aplicación extrae todos los QTL detectados por MAPQTL, utilizando el archivo Map Map, encuentra el marcador más cercano y finalmente coloca el número de qtls que se encuentran para cada marcador en el mapa. Este enfoque le permite encontrar rápidamente el potencial punto de acceso QTL en su conjunto de datos. Esto es particularmente útil para el análisis de QTL grande en un gran número de rasgos. Inicie el proyecto: hay dos formas de instalar este proyecto: de las fuentes: clonar el clon https://github.com/pbr/mq2.git- Ingrese la carpeta y ejecute el SetUP.PY ScriptCD MQ2SUDO PYTHON SETUP.PY installfrom PyPi- Descarga e instale el proyecto de PyPIEASY_INSTALL MQ2RUN El proyecto: Para ejecutar el proyecto, simplemente ejecute el script MQ2 proporcionado.see MQ2 --Help o MQ2 -H Para el argumento diferente disponible. Actualización: este proyecto contiene pruebas de unidad que le permiten verificar si el código se comporta como debería. Para ejecutarlos, dos formas, ya sea: Nosetestsfrom la carpeta MQ2, o: Python Test.pywitin la página de inicio de la FolderProduct de Python.py

MQ2 Software relacionado