Química :: Archivo :: PDB Reader / escritor
Descargar ahora

Química :: Archivo :: PDB Clasificación y resumen

Química :: Archivo :: PDB Etiquetas

lector perla pdb lector de AP Escritor de PDB Banco de datos de proteínas

Química :: Archivo :: PDB Descripción

Formato de archivo de datos de proteínas de datos lector / escritor Química :: Archivo :: PDB es un módulo PERL que lee y escribe archivos PDB. El formato de archivo PDB se usa comúnmente para describir proteínas, particularmente las que almacenan en el Banco de Datos de proteínas (http://www.rcsb.org/pdb/). La versión actual de este módulo solo lee los siguientes tipos de registros, ignorando todo lo demás: Atom Hetatm EndMDL EndMDL EndTe Módulo registra automáticamente el formato 'PDB' con la química :: Mol, para que los archivos PDB puedan ser identificados y lean por química :: Mol- > leer (). Para púas de autodetección, asume que los archivos que terminan en .pdb o que tienen una línea de coincidencia / ^ (átomo | hetatm) / son archivos PDB. El lector PDB y el escritor están diseñados para tratar con la química :: Objetos de MacRomol, pero también puede crear y use la química :: Objetos MOL al lanzar una información de distancia. HSYNOPSIS Use Química :: Archivo :: PDB; # Lea un archivo PDB My $ macro_mol = química :: macromol-> lee ("myfile.pdb"); # Escriba un archivo PDB $ MACRO_MOL-> escriba ("OUT.PDB"); # Lea todos los modelos en un archivo multi-modelo My @mols = química :: macromol-> lee ("models.pdb"); # Lea un modelo a la vez My $ File = Química :: MacRomol-> Archivo ("Models.PDB"); $ file-> abierto; Mientras (MIS $ MOL = $ FILO-> READ_MOL ($ File-> FH)) {# Haga algo con $ Mol} Requisitos: · Perl

Química :: Archivo :: PDB Software relacionado