Sedwatergentador Un programa gráfico de Python para segmentar interactivamente las pilas de imágenes de células en el tejido con etiquetas de borde
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SeedwaterSegmenter es una herramienta gráfica de python para segmentar interactivamente las pilas de imágenes de células en tejido con etiquetas de borde (aka. Contornos blancos). Las interacciones se basan totalmente en la edición de semillas, que a su vez se expanden mediante un algoritmo de cuenca. La principal diferencia entre SWS y otras herramientas es que puede colocar más de una semilla por celda, lo que puede ayudarlo a ajustar los límites de los células difíciles.s.s.s.su se basa en la parte superior de WXPYTHON, MATPLOTLIB, adormecida, scipy y mahotas.at su núcleo , utiliza un algoritmo de cuencas hidrográficas de relámpago (gracias al proyecto MAHOTAS) y permite actualizaciones en tiempo real. Tiene una UI sencilla (si está desordenada) y es completamente interactiva, incluso incluyendo el deshacer de 1 nivel. La publicación sobre SWS que proporciona todos estos detalles y más en la Citometría Parte A: http: //onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002 El código /CYTO.A.22034/ABSTRACTSOURCE se refleja a cuatro repositorios y a PYPI: - GITHUB: http://github.com/davidmashburn/seedwatergmenter/- bitbucket: http://bitbucket.org/davidmashburn/seedwatergentger- gitorious: http://gitorious.org/seedwateregmenter- Código de Google: http://code.google.com/p/seedwater/- pypi: http://pypi.python.org/pypi/seedwatergentytEl página de códigos de Google también tiene algunos binarios Lanzamientos (http://code.google.com/p/seedwater/) que deben funcionar en Windows de 32 bits o Linux de 64 bits, pero ahora son viejos. Utilice el método "Easy_Install" ahora. Para ver más detalles, consulte las instrucciones de instalación de Python 20xx.txt También puede querer leer el manual: Seedwater segmenter v XX Manual.txtInstalling y el manecando la instalación es finalmente fácil! De hecho, ahora puede "Easy_Install SeedwaterSegmenter "Instrucciones rápidas: Windows / Mac: Instale Distribución de Python entallada http://www.entugh.com/products/edudownload.phpubuntu/debian: sudo apt-get install Python-setuptools Python-Wittools Python-Wartpy Python-Scipy Python- MATPLOTLIB PYTHON-PYTHON-XLRD PYTHON-XLRD PYTHON-XLWTIN A CMD Ventana (debe ejecutarse como administrador en Windows Vista / 7) o Terminal (Mac / Linux), Ejecutar: Easy_Install Mahotas MAHOTAS CMPGEN ELIPSEFITTER FILENAMIENTO ENFILENAMIENTO IMAGIAMIENTO IMAGRECUMNUR SEDEWERSEGMENTEDETETETE INSTRUCCIONESADA: La última versión se llama: "Instrucciones de instalación de Python August 2012.txt" https://github.com/davidmashburn/seedwatergmenter/blob/master/python Instale Instruction Agosto 2012.txtProduct's Página de inicio

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