Taberna

Un complemento de flujo de trabajo de cómputo distribuido en Java
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Taberna Clasificación y resumen

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  • FREE
  • Nombre del editor:
  • Tom Oinn
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Taberna Descripción

Componentes de flujo de trabajo de cómputo distribuido en Java Taverna es una colección de componentes de promulgación y descripción de flujo de trabajo, incluido un lenguaje de alto nivel para flujos de trabajo llamados SCUFL (lenguaje de flujo unificado conceptual simple), un modelo de objeto Java puro, analizador para rellenar el modelo y un conjunto de vistas y controladores (incluidos algunos Componentes de swing para pasar en sus aplicaciones habilitadas para flujo de trabajo). Para ejecutar realmente los flujos de trabajo, también necesita el motor de promulgación de flujo de trabajo de MyGrid. Los modelos de datos básicos de THAVERNA incluyen las representaciones de objetos del flujo de trabajo, todas las entidades dentro del flujo de trabajo (procesadores, puertos, enlaces de datos, etc.) y el modelo para los valores de datos que fluyen. A lo largo de los enlaces de datos durante una promulgación de flujo de trabajo. Las extensiones de tareas de Tallerna se sientan dentro de un motor de promulgación, en este caso FreeFluo, y proporcione implementaciones concretas de las tareas abstractas especificadas por los objetos del procesador dentro del modelo de objeto de flujo de trabajo. Es estas tareas que contienen la lógica requerida para ponerse en contacto con los servicios web, ejecutar clases locales de Java y realizar las otras acciones asociadas con sus entidades de procesador. Se crean horarios de las extensiones de tareas cuando se envían un flujo de trabajo y los objetos de entrada asociados a través de la interfaz de envío de flujo de trabajo . Esta interfaz puede ser una llamada de método de Java en proceso o puede invocarse en algún transporte, como jabón en el caso de un motor de representación basado en servicio remoto. FreeFluo es capaz de actuar en ambos modos, la Taverna Workbench incorpora una instancia del Enactor FreeFluo para proporcionar servicios básicos de promulgación a los usuarios sin un servidor de motores de flujo de trabajo central. Las clases de interfaz de usuario gráficas se sientan en una máquina cliente y permiten la interacción con los datos principales. Clases de modelo, así como con los objetos de instancia de flujo de trabajo en ejecución dentro de un motor de promulgación. Esto permite la construcción, edición y visualización del flujo de trabajo, así como la gestión del enactor y la navegación de datos a través de los resultados y los valores intermedios dentro de una instancia de flujo de trabajo. La interfaz de almacenamiento es un marco complementario que permite que los datos externos y las tiendas de metadatos observen los eventos dentro del servicio de promulgación de flujo de trabajo y Recopilación de información sobre esos eventos. Esto podría incluir un complemento de recolección de procedencia que observa la promulgación de flujo de trabajo y registra los metadatos al respecto en el formulario RDF, o un complemento de almacenamiento que transmite los resultados a una base de datos de relaciones, posiblemente una autoridad identificadora de ciencia de la vida (LSID), como la promulgación. La interfaz de autoridad LSID es un punto de acceso de solo lectura a los datos almacenados dentro de un almacén de datos, y los componentes de la interfaz de usuario gráficos pueden ser utilizados por los componentes de la interfaz gráfica de la Taverna para recuperar los resultados de los flujos de trabajo anteriores y utilizarlos como entradas a los sucesivos. Requisitos: · Java 2 Edición estándar Medio de ejecución ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: Bicho: · - Fetching Results impredecible · - SVG Renderer no funciona · - Pestaña predeterminada "metadatos" para puertos de entrada / salida confusa · : flujos de trabajo fallidos se destina a los resultados vacíos · - Columna 'Thing' demasiado corto en el esquema de la base de datos de Logbook · - Error de promulgación T2 con flujo de trabajo de Pauls · - Diálogo de entrada T2 no se abre después de un error · - SCOVERGER DE TRABAJO SCOVENGER POR PUERTOS Y CONTENIDO DE SCRIPTO PARA RSHELL · - Evite la dependencia de Raven / Maven para el servicio de ejecución remota · - Servicio de ejecución remota con perfil de taberna desactualizado · - TestjavAvaprocess falló durante la construcción de Maven · - T2 Valdation falla para procesadores que contienen puertos fusionados. · - T2 FiledAtamanager y FileBlobStore usa archivos.mkdirs que no es seguro · - GOVIZ no está ahí · - La documentación está desactualizada · - JTidyWorkerTest falla debido a los supuestos de caracteres Mejora: · : la versión de ejecución del flujo de trabajo debe ser la misma que la versión de edición. · - Ubicación anidada del flujo de trabajo · - Las salidas desconectadas fallan el flujo de trabajo · - Mac OS X PLIST FILE MEJORAS · - Añadir excepción de host desconocido en el pluginManager Nueva caracteristica: · - Navegador incrustado dentro de Taverna · - Serialice Bean a Stream En lugar de Archivo · - T2 Renders Refinamiento: · - Editor de flujo de trabajo mejorado agregando habilidades de arrastrar y caídas mejoradas Tarea: · - Permitir múltiples implementaciones de la interfaz del monitor


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