nebgbico Historias de anotación de los archivos GenBank.
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Historias de anotación de archivos GenBank. Nebgbhist contiene herramientas para la construcción de historiales de anotación de múltiples archivos de GenBank. Ejemplo: $ MKDIR GBHIST $ NEB-REV-FETCH -D GBHIST NC_008512 $ Neb-Gbhist -d GBHIST | neb-diff-apply nc_008512.git $ git --git-dir = nc_008512.git gc --ggression $ neb-validalate-historia -p nc_008512.git -g gbhist / 2009-04-29-04-04.gbkplaying con Filesif Usted clone el repositorio del paquete después de la construcción, puede meterse en el contenido del sistema de archivos. Para los genomas más grandes con muchas ediciones, esto puede ejecutar AFOUL de los límites de entrada de directorios hasta que reescriba el almacenamiento de objetos. Para la Carsonella (NC_008512) Ejemplo. Uso No hay un problema. $ Git clone nc_008512.git $ cd nc_008512 $ ls -1accession dblink Palabras clave Objetos / seq / versionComment Definición Locus Ref / SourceFiles En el directorio raíz que representan palabras clave definidas en el Archivo genbank. Los subdirectorios REF y SEQ contienen información sobre referencias y las hashes de secuencia. El directorio de Objetos enumera las características en el historial. Los objetos de archivos / conocidos y objetos / vivos son diccionarios de los hashes que apuntan hacia la versión actual de una característica en una ubicación determinada. Las características activas son cualquier cosa que no se elimine ni se reemplaza con una nueva versión.Developer Commenti recomiende que trabaje con los objetos Nebpack.Pack si desea hacer algo con los objetos. Requisitos: · Python

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