nmr-relájate

NMR-Relax está diseñado para el estudio de la dinámica de las proteínas u otras macromoléculas.
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  • Licencia:
  • GPL
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  • FREE
  • Nombre del editor:
  • Edward d'Auvergne
  • Sitio web del editor:
  • https://gna.org/projects/minfx/

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nmr-relájate Descripción

NMR-Relax está diseñado para el estudio de la dinámica de las proteínas u otras macromoléculas. NMR-Relax está diseñado para el estudio de la dinámica de las proteínas u otras macromoléculas a través del análisis de los datos de relajación de RMN. Es un proyecto impulsado por la comunidad creado por espectroscopistas de RMN para espectroscopistas de RMN. Admite el ajuste de la curva exponencial para el cálculo de las tasas de relajación R1 y R2, el cálculo de la NOE, la asignación de densidad espectral reducida y el análisis libre de modelos Lipari y Szabo. Aquí hay algunas características clave de "NMR-RELAX": · Teorías de RMN compatibles Las siguientes técnicas de análisis de datos de relajación están actualmente compatibles con Relax: · Análisis sin modelo (Lipari y Szabo, 1982a; Lipari y Szabo, 1982b; Clore et al., 1990) · Mapeo de densidad espectral reducida (Farrorow et al., 1995, Lefevre et al., 1996) · Ajuste de curva exponencial (para encontrar las tasas de relajación R1 y R2) · Cálculo de NOE de estado estable · Herramientas de análisis de datos. Las siguientes herramientas se implementan como componentes modulares que deben ser utilizados por cualquier técnica de análisis de datos: · Numerosos algoritmos de optimización de alta precisión. · Selección de modelos (D'AUVERGNE y GOOLEY, 2003) · Criterios de información de Akaike (AIC) · Tamaño de muestra pequeño AIC corregido (AICC) · Criterios de información bayesiánea o Schwarz (BIC) · Selección del modelo de bootstrap · Validación cruzada de un solo artículo (CV) · Hipótesis que prueban la selección del modelo ANOVA (solo se admite la técnica específica de Modelo de Mandel et al., 1995) · Simulaciones de Monte Carlo (Análisis de errores para todas las técnicas de análisis de datos) · Eliminación de modelos: la eliminación de modelos fallidos antes de la selección de modelos (D'AUVERGNE y GOOLEY, 2006) Requisitos: · Python ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: · Esta es una versión muy pequeña de Bugfix que resuelve problemas con la función de usuario Value.Write () y con el análisis de errores al realizar la adaptación de la curva de relajación.


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