simulación Medio de simulación de la simulación de la genética de la población delantera
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Entorno de simulación de la genética de la población delantera. Simupop es un módulo de simulación de genética de la población de tiempo adelante escrita en Python. El núcleo de Simupop es un lenguaje de scripting (Python) que proporciona una gran cantidad de objetos y funciones para manipular a las poblaciones, y un mecanismo para evolucionar a las poblaciones hacia adelante en el tiempo. En este entorno similar a R / SPLUS, los usuarios pueden crear, manipular y evolucionar. Poblaciones de forma interactiva, o escriba un script y ejecútelo como un archivo por lotes. Debido a su diseño flexible y extensible, Simupop puede simular procesos evolutivos grandes y complejos con facilidad. Un nivel más fácil de usar, SIMUPOP proporciona un número creciente de scripts incorporados que realizan simulaciones que van desde la implementación de modelos de genética de población básica hasta generar Conjuntos de datos en escenarios evolutivos complejos. Requisitos: · Python ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: · ERROR: Fije un error con la población :: Removeloci cuando se le da MANTENGE LOCI no están en orden. · Nuevo: prevenir el uso de mayores que una probabilidades en los senderos de Bernulli. · Nuevo: agregue una implementación de tkinter para Simuprogress. · ERROR: Fije un error donde las nombres de subpoblación de la población fusionada no se fusionan correctamente. · Nuevo: permitir la especificación de valores sin cadena en 'Elegirde' y 'ElegirOneF' en la especificación de parámetros SIMUOPT. · Nuevo: Permitir que los operadores se envíen a una función de Python. · Nuevo: permitir el uso de doble clic para abrir un cuadro de diálogo Examinar para obtener información sobre el archivo y la entrada del directorio en Simuopt. · ERROR: Fije un error de fuga de memoria relacionado con infoEval e InfoExec. Optimice a InfoExec para algunas afirmaciones simples. · CHG: Cambiar el parámetro FormOffGenotype of Pyoperator a isTransmitter como resultado de fusionar los conceptos 'primario durante el operador de apareamiento' y 'genotipo del transmisor'. · CHG: Mueva todos los scripts debajo del directorio de scripts a Cookbook en línea. · CHG: Cambiar los cálculos de relación en el operador Stat. · Nuevo: agregue el cálculo del valor HWE P al operador de estadísticas. · Nuevo: Pruebe el índice individual en la población :: RemoverIndividual · Error: fije un error cuando no se da una subpoblación en Splitsubpops. · CHG: Merge Stat (Association) a STAT (LD), en preparación para pruebas de asociación de casos-controles. · Nuevo: (Experimental) Agregar caso / Asociación de Control CHISQ PRUEBA A ESTADA. · Nuevo: (Experimental) Agregue las estadísticas de PI de Tajima (Diferencia de pares promedio) al operador STAT ().

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