3DNA 3DNA: analice y reconstruya las estructuras de ácido nucleico 3D, basadas en un marco de referencia estándar.
Descargar ahora

3DNA Clasificación y resumen

3DNA Etiquetas

analizar ADN reconstruir Analizar el ADN estructura de ADN reconstruir el ADN

3DNA Descripción

3DNA: analice y reconstruya las estructuras de ácido nucleico 3D, basadas en un marco de referencia estándar. 3DNA es un paquete versátil para analizar y reconstruir estructuras de ácido nucleico tridimensional, basado en un marco de referencia estándar. En su núcleo, el software utiliza un esquema simple, pero riguroso y geométricamente sensible, geométricamente, para calcular un conjunto completo de base local. pares, paso y parámetros helicoidales, y permite la reconstrucción exacta de una estructura basada en estos parámetros. Las características de las universidades de 3DNA incluyen la clasificación automática de una etapa de dinucleótido como A, B- o TA, en base al posicionamiento del fósforo. Los átomos, y la generación de diagramas de apilamiento de base "estandarizados". Los estilos esquemáticos de Calladine-Drew reciben representaciones esquemáticas como modelos atómicos completos con la columna vertebral de fosfato de azúcar y de ADN, así gracias a las rutinas de reconstrucción. El Dr. Xiang-Jun Lu creó en el laboratorio del profesor Wilma K. Olson en el Departamento de Química y Biología Química, Rutgers, la Universidad Estatal de Nueva Jersey. Desde que sale de Rutgers, el Dr. Lu ha seguido trabajando en este proyecto como consultor independiente en su tiempo libre. Este sitio web actualizado proporciona a los usuarios más información sobre fondo y detalles técnicos sobre 3DNA, incluidos los ejemplos de trabajo. Por lo tanto, aquellos que están realmente interesados ​​en las estructuras de ácido nucleico pueden tener una comprensión clara de "lo que está sucediendo en esa caja negra" .3DNA se ha beneficiado enormemente de las interacciones con el proyecto de base de datos de ácido nucleico (NDB) liderado por el profesor Helen Berman. Dr. Zukang Feng en el PDB / NDB, Dr. AR SRINIVARSAN, Sra. Yurong Xin, Sr. Andrew Colasanti, Sr. Jin Tao, Sra. Fei XU y otros miembros del laboratorio de Olson. Y numerosos usuarios de todo el mundo Han ayudado a hacer una mejor herramienta para servir a la comunidad científica.

3DNA Software relacionado