Annotate Secuencia con GFF

Anote una secuencia con anotaciones de un archivo GFF.
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Annotate Secuencia con GFF Clasificación y resumen

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  • Rating:
  • Licencia:
  • Freeware
  • Nombre del editor:
  • CLC bio
  • Sitio web del editor:
  • http://www.clcbio.com
  • Sistemas operativos:
  • Mac OS X 10.0 or later
  • Tamaño del archivo:
  • 373 KB

Annotate Secuencia con GFF Etiquetas


Annotate Secuencia con GFF Descripción

La secuencia anotada con GFF es un complemento que le permite anotar una secuencia con anotaciones de un archivo GFF (formato de característica genérico) en CLC Workbench o CLC Server. Un archivo GFF no contiene ninguna información de secuencia, solo contiene una lista de anotaciones. Puede leer más sobre el formato en http://www.sanger.ac.uk/Software/Formats/GFF. También puede usar archivos GTF (formato de transferencia de genes). Este formato es utilizado entre otros, el navegador del genoma de UCSC en http://genome.ucsc.edu. Si descarga una pista de anotación (por ejemplo, SNPS, Repite), puede obtener esto como un archivo GTF. ¡Nota! Los archivos GTF descargados del navegador del genoma de UCSC no son compatibles con el análisis de ARN-SEQ de CLC Genomics Workbench porque las anotaciones del gen y la transcripción no se pueden coincidir. Nota: la secuencia anotada con el software GFF es solo para fines de investigación.


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