| Bndlst BNDLST - Lista Información de conectividad para átomos en un archivo PDB |
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Bndlst Clasificación y resumen
- Nombre del editor:
- Mike Word
- Sitio web del editor:
- http://kinemage.biochem.duke.edu/software/kincon.php
- Sistemas operativos:
- Mac OS X
- Tamaño del archivo:
- 34 KB
Bndlst Etiquetas
Bndlst Descripción
BNDLST: lista Información de conectividad para átomos en un archivo PDB BNDLST es una aplicación gratuita que enumerará la información de conectividad para los átomos en un archivo PDB.BNDLST lee un archivo de formato PDB y para cada átomo imprime una lista de átomos vecinos covalentes y en condiciones de vídeos, junto con varias propiedades atómicas. Se emite un registro para cada átomo, seguido de un registro para cada átomo en que está conectado, terminando en un registro de EOL que señala el final de la lista. Por defecto, solo se enumeran los vecinos enlaces H-Bond y los vecinos enlaces más cercanos. Alternativamente, al usar el -Neighbors, -RAD # y -Cut # es posible mostrar no HBonds no unidos, y no mostrar los átomos unidos de cierre. Puede resultar muy útil cuando uno tiene que construir scripts que procesan estructuras atómicas.
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