Césimo CESE - entorno integrado para realizar simulaciones computacionales utilizando una variedad de modelos electrofisiológicos
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Entorno integrado de CESE para realizar simulaciones computacionales utilizando una variedad de modelos electrofisiológicos. CESE (entorno de simulación de electrofisiología celular) es un marco integral específicamente diseñado para realizar simulaciones electrofisiológicas computacionales, por ejemplo, simulaciones de actividad eléctrica de miocitos cardíacos. CESE es útil para simulaciones de potenciales de acción, corrientes iónicas individuales y cambios en las concentraciones iónicas. Es un programa multiplataforma y se ejecutará en cualquier sistema que tenga el entorno de tiempo de ejecución de Java (JRE) versión 1.5 (5.0) o superior. Fue probado en MacOS X, Windows, Linux, Solaris y AIX.Cese es un entorno integrado para realizar simulaciones computacionales utilizando una variedad de modelos electrofisiológicos. Esta etapa CESE permite la creación y ejecución de los modelos de una sola célula (que contiene tanto Hodgkin -HUXLEY (HH) y formulaciones de corriente de Markovia). Los modelos de actividad eléctrica de los miocitos cardíacos con código fuente se incluyen en la distribución CESE. Esperamos ampliar la cantidad de modelos disponibles, y agregar ciertos modelos neuronales en el futuro. La principal resistencia de la CESE está en su uniformidad: una interfaz del programa sigue siendo la misma para diferentes tipos de modelos. Puede cambiar fácilmente entre modelos y comparar las salidas de simulación. Los parámetros del modelo se pueden modificar, seleccionados para la salida y / o sujetados de la misma manera, la forma estándar. Cese extiende el significado electrofisiológico convencional de la "abrazadera de voltaje". Puede sujetar virtualmente cualquier variable de modelo, incluido el voltaje (potencial de membrana), las corrientes iónicas totales o individuales, las concentraciones iónicas, la temperatura, las variables de gatting, etc. Los comandos de sujeción pueden ser funciones de piezas complejas, establecidas individualmente para la variable modelo de interés. . Esto abre infinitas posibilidades para la exploración del comportamiento modelo complejo. Proporciona visualizaciones de datos simples, pero eficientes. Los resultados de la simulación se pueden presentar en las formas gráficas y tabuladas. Las parcelas se pueden personalizar, y las regiones de interés zoomed. Aunque Cese no se diseñó para ser una herramienta de análisis de datos, puede generar relaciones de voltaje actual (I-VS) y calcular los parámetros estadísticos para una señal dada dentro del programa. Puede exportar sus datos a ASCII, archivo de texto AXON (ATF) y formatos NETCDF para continuar el análisis en su paquete favorito. ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: · GUI agregada para cambiar los tipos de parcela. 4 Tipos de parcela están disponibles: línea, símbolo, histograma y columna. Emisión . (Sm) · Se agregó pantalla de bienvenida (actualmente establecida en la encuesta CESE). (Sm) · Impresión vacía fija bajo ciertas condiciones. (Sm) · Acción de registro de bloqueo fijo que no se mantiene bloqueado. (Sm) · Mejora del rendimiento en la leyenda de la trama. (Sm) · Cambió la ubicación de directorio predeterminada a "Mis documentos / CESE-1.4" en Windows. (Sm)

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