CLC Banco de trabajo principal Programa de bioinformática para la proteína avanzada y el análisis de la secuencia de ADN.
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análisis bioinformática ADN Análisis de ADN Herramientas de bioinformática secuencia de proteínas

CLC Banco de trabajo principal Descripción

Programa de bioinformática para análisis avanzado de proteínas y secuencias de ADN. Esta demostración completamente funcional de la demostración totalmente funcional de la mesa de trabajo principal de CLC agrega todos los análisis de secuencias de ADN de la banca de trabajo del gen CLC y todos los análisis de secuencia de proteínas de la proteína de la proteína de CLC Workbench.clc El banco de trabajo principal es una herramienta que integra todos los análisis en una sola individual, fácil de usar, y aplicación de software intuitiva. Aquí hay algunas características clave de "CLC Main Workbench": · Montaje de datos de secuenciación de ADN. · Diseño de imprimación avanzado. · Clonación molecular. · Anotación automática SNP de secuencias. · Predicción de la estructura de proteínas secundarias. · Vista molecular 3D integrada. · Predicción peptídica de señal (Signalip). · Predicción de la hélice transmembrana (TMHMM). · Análisis de la familia de proteínas (PFAM). · 2 tipos de alineaciones. · Filogenética. · Búsqueda de motivos (patrones conocidos). · Discovery de patrones (patrones desconocidos). · EXPLOSIÓN. · Procesamiento por lotes de múltiples análisis en un solo paso. · Parcelas de puntos. · Análisis de hidrofobicidad. · Análisis de la antigenicidad. · Búsquedas en Genbank, Swissprot, Trembl y Pubmed. · Registro detallado de acciones / análisis realizados. Requisitos: · RAM 256 MB requerido. · 512 MB RAM recomendado. · 1024 x 768 Visualización recomendada. Limitaciones: · 4 semanas de período de prueba completamente funcional. ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: Análisis de la expresión: · Parcelas de volcán: ahora puede elegir los valores para trazar en el eje X. Elija entre "diferencia" y "cambio de pliegue". Lee mas... · La vista de tabla de las parcelas de barras muestra los mismos intervalos que se muestran en la parcela de la barra. · Importador genérico para datos de expresión de expresión en formato tabular. Lee mas... · Importador genérico para los datos de anotación de experimentos de expresión en formato tabular. Lee mas... · Los archivos de ontología GENE (IR) ahora se pueden usar para anotar un experimento de expresión. Lee mas... · Profilado de la etiqueta: ya no se le permite anotar muestras de etiquetas, solo experimentos · El panel lateral de la tabla de experimentos se ha vuelto a organizar para proporcionar una mejor visión general. Lee mas... · La secuencia de consenso de apertura, incluidas las brechas, también pondrá NS antes de que comience la secuencia de consenso y después de que termine. Despliegue: · Puede establecer una ruta a la ubicación de datos predeterminada utilizada cuando se inicia el banco de trabajo por primera vez. Esta es una característica para ayudar a los administradores del sistema a controlar dónde las nuevas instalaciones por predeterminado guardan sus datos. Lee mas... · Soporte para eliminar herramientas que acceden a Internet (NCBI BLAST, Notificaciones de actualización, etc.). Lee mas... Importación general y exportación: · Soporte para la importación de regiones complejas de los archivos GFF · Exportar tablas e informes en formato Excel. · Importar sección del manual del usuario reestructurado para proporcionar una mejor visión general. Lea más .... Los importadores de datos de expresión ahora se describen en los detalles técnicos en una sección separada. Lee mas.... · Ahora puede exportar múltiples listas de secuencias en formato FASTA · Ahora se admite la importación forzada de archivos ZIP (forzará a importar los contenidos del archivo zip) · La importación estándar ahora acepta archivos GZIP y TAR, así como con cremallera. · Si una importación forzada falla, habrá información más técnica sobre lo que salió mal, lo que le permitirá identificar el mal formato de los archivos de importación · Tanto GenBank como GFF Importer ahora hacen varios intentos de nombrar genes que no tienen un nombre genético. Intentará iterativamente los siguientes calificadores: "Producto", "locus_tag", "protein_id" y "transcript_id" · Al importar archivos GenBank donde la longitud indicada no coincide con la secuencia real, se muestra una advertencia, pero se acepta la secuencia. · Al exportar en formato CSV, las configuraciones de la configuración regional se utilizan para determinar si la coma o los semisolones se deben usar como delimitador (coma utilizada para los locales estadounidenses) · El complemento GFF se ha actualizado para aceptar anotaciones complejas Diverso: · Retroceso avanzado de anotaciones utilizando la tabla de anotación. Lee mas... · Informes mejorados de situaciones cuando un disco completo evita que se ahorre datos. · La descarga de secuencias usando arrastrar y soltar de la tabla de búsqueda ya no crea un nodo de "descarga ..." en la carpeta. El proceso de descarga se puede monitorear en la pestaña Procesos. · El diseño de imprimación ahora es compatible con fragmentos de PCR a más de 5000 pb. · Extraer secuencias movidas de archivo Manu a Toolbox-> Análisis de secuencia general. Lee mas... · Mejores comentarios de progreso en varios diálogos. Corrección de errores: · Problema fijo que muestra la etiqueta "Copiar ..." al copiar datos y luego actualizar la carpeta · Problema fijo con el nombramiento de las pestañas. La solución significa que, en Windows y Linux Datos no guardados ahora obtienen un * en lugar de hacer el nombre de la pestaña en negrita y cursiva. (Esto siempre ha sido el comportamiento en Mac OS X).

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