Ceder le permite leer archivos PDB y generar una tabla para cada residuo o base
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Ceder Descripción

Le permite leer archivos PDB y generar una tabla para cada residuo o base DAG es un programa gratuito y simple de UNIX C ++ creado para leer un archivo de coordenadas de la estructura de la estructura de proteínas (PDB) y genera una tabla de varias mediciones geométricas útiles para cada residuo o base. En su forma más básica, Dang escribe los ángulos dihedral (PHI, PSI, CHI #), por lo tanto, Thename. Dang también identifica los enlaces disulfuro. Para los ácidos nucleicos, se genera el ángulo de pseudo-rotación. La salida está formada para facilitar el análisis por AWK, GREP, STORD y otras utilidades UNIX. La bandera -Extra agregará Tau, Omega, Max B, Min OCC, CA Pseudo-dihedral, CA-CA Distancia. Los escritos para analizar la producción de Dang en las tablas delimitadas están disponibles aquí.

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