| Clasificador RDP Clasificador de Bayesian ingenuo que puede proporcionar de manera rápida y precisión asignaciones taxonómicas del dominio al género |
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Clasificador RDP Clasificación y resumen
- Nombre del editor:
- Qiong Wang
- Sistemas operativos:
- Mac OS X
- Tamaño del archivo:
- 13.3 MB
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Clasificador RDP Descripción
Clasificador bayesiano ingenuo que puede proporcionar de manera rápida y precisión asignaciones taxonómicas del dominio al género Clasificador RDP es un clasificador de Bayesian ingenuo que se desarrolló para proporcionar una colocación taxonómica rápida basada en datos de secuencia de RRNA. El clasificador RDP puede clasificar de manera rápida y precisa las secuencias de RRNA bacterianas en la nueva taxonomía de orden superior propuesta por la confianza de Bergey. Proporciona asignaciones taxonómicas del dominio al género, con estimaciones de confianza para cada asignación. El clasificador RDP no se limita a usar la taxonomía bacteriana propuesta por los editores de Bergey. Funcionó igualmente bien cuando se formó en la taxonomía NCBI. El clasificador RDP probable puede adaptarse a taxonomías bacterianas filogenéticamente coherentes adicionales. El clasificador RDP le permitirá asignar fácilmente las secuencias de genes de RRNA de 16S a la nueva taxonomía bacteriana de orden superior filogenéticamente constante propuesta por Garrity et. Al.hierArchical Taxa se basa en un clasificador de RRNA bayesiano ingenuo. El clasificador recién capacitado permite la clasificación de secuencias de RRNA de 16S bacterianas y arcaeales. ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: · La versión anterior clasificaría las secuencias sin palabras válidas. · Cambiado para requerir una nueva variable min_good_words y configurarla para ser min_seq_len - secuencia.wordsize.
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