Colina baja Paquete de simulación y análisis macro-evolutivo
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Análisis macro-evolutivo y paquete de simulación. Las filogenias están fumando armas. Una historia evolutiva tiene en su forma en su forma las huellas dactilares de cada proceso que efectuó su creación: extinciones, adaptaciones clave, radiaciones, colonizaciones, cambios en el tempo y modo de macroevolución. Desafortunadamente, analizar las filogenes es difícil. Los cálculos de interés para cualquier investigador son a veces intrincados y intensivos en mano de obra. También son a menudo en varios programas, si hay una implementación de software en absoluto. La importancia estadística de los resultados a menudo requieren la comparación de cientos a miles de árboles. Finalmente, las métricas pueden ser frágiles para el modo de evolución, una filogenia creció. El resultado de estos problemas es que el análisis filogenético suele ser un trabajo duro, y es difícil saber qué hacer con las respuestas. MESA es una aplicación de software creada para aliviar estos problemas. Aunque Mesa realmente solo hace cuatro cosas, la gran victoria para sus usuarios es que todos estos están en un paquete de software y se pueden usar en conjunto entre sí, y semi-automatizados. Estos, los problemas de transferir datos entre programas y posibles corrupciones. O la mala intención de los resultados se evita. Nota: Mesa no está relacionada con la biblioteca de gráficos, la hoja de cálculo, la aerolínea, la asociación académica, la universidad, el motor de búsqueda, la sociedad de la ingeniería, la ciudad o la característica topográfica del mismo nombre. Aquí hay algunas características clave de "Mesa": Manipulaciones: · MESA permite que los conjuntos de datos se manipulen en formas sofisticadas. Los árboles filogenéticos y los rasgos de la historia de la vida se pueden editar, duplicados o eliminados. Las longitudes de rama se pueden modificar sistemáticamente, se eliminan los taxis de acuerdo con las condiciones complejas, los rasgos modificados a nivel mundial y selectiva. Todo el conjunto de datos también se puede respaldar y restaurar en cualquier momento. Análisis: · MESA incorpora una gran cantidad de cálculos que pueden analizar la diversidad dentro de una filogenia (por ejemplo, la diversidad filogenética), la diversidad en todas las comunidades (por ejemplo, el índice de Shannon-Weiner), las medidas del proceso macroevolutivo (por ejemplo, el desequilibrio de Fusco-Cronk) y recopilan información selectiva a través de los taxones. . Simulaciones: · MESA permite que las filogenias se cultiven en escenarios sofisticados donde las tasas de especiación y extinción pueden efectuarse por los rasgos de los taxones involucrados o atributos globales de la filogenia. Las simulaciones pueden ser adornadas aún más por las extinciones masivas y la evolución de los rasgos de la historia de la vida. Automatización: · Para permitir la producción y las pruebas de una gran cantidad de filogenes, MESA permite a los usuarios construir cadenas de acciones (manipulaciones, análisis y simulaciones) que se pueden ejecutar como una sola unidad, en bucle sobre los grupos de comandos, guardar y restaurar datos. Por lo tanto, uno puede generar fácilmente probar una gran cantidad de réplicas para la validez estadística. ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: · Para las razones técnicas oscuras (finales de línea y modos de lectura), la versión para PC de MESA se negaría a leer algunos archivos que se leyeron bien en la Mac. Ahora parece ser arreglado. Gracias a Henri por identificar este problema.

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