D2MD Suite

Suite de acoplamiento molecular de DNA-droga
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D2MD Suite Clasificación y resumen

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  • Rating:
  • Licencia:
  • GPL
  • Nombre del editor:
  • Paolo Gatti
  • Sitio web del editor:
  • http://code.google.com/u/108310999894101472719/
  • Sistemas operativos:
  • Mac OS X
  • Tamaño del archivo:
  • 4.1 MB

D2MD Suite Etiquetas


D2MD Suite Descripción

D2MD Suite es una colección de aplicaciones que intentan ayudar a la automatización y el procesamiento de lotes en los estudios de acoplamiento molecular de los complejos de drogas de ADN.Autodock Helpera simple GUI a los programas Autogrid y AutoDOCK, en el caso de que la GUI de AutoDockTools también sea también para usted. Soquivements : · Java 6 · AUTODOCK 4.2VINA Helperstarting desde un archivo AutoDock 4.2 Grid y el Ligand PDBQT, este programa le permite realizar una simulación de acoplamiento por AUTODOCK VINA sin tener que construir ningún archivo de configuración o recalcular ninguna cuadrícula. Requisitos: · Java 6 · AUTODOCK 4.2 · AUTODOCK VINA 1.1.2Energy AnalzerPUT DE AUTODOCK Y VIA Simulaciones se pueden analizar mejor con estas herramientas, al hacer una media en todas las conformaciones o en un conjunto de clúster de RMS en particular. Requisements: · Java 6 · AutoDock 4.2 · AutoDock VINA 1.1. 2 · MGLTOOLS 1.5.6RC2VINA DOCKINGTE ESTE PROGRAMAS ES UNA SIMULACIÓN DE ENCANTAMIENTO DE ADN-DROGA DE ADN-DROGA DE ADN completo. Está completamente automatizado, ya que a partir de los archivos de Ligand y DNA PDB se necesita solo para seleccionar uno de los espacios de intercalación descubiertos automáticamente (o ninguno si el acoplamiento ciego) y iniciar una simulación. Requisements · Java 6 · Java 3D 1.5.2 · BioJava 3.0. 2 · AUTODOCK VINA 1.1.2 · MGLTOOLS 1.5.6RC2D2MD Suite es una utilidad multiplataforma capaz de funcionar en cualquier sistema operativo que viene con el soporte de Java (por ejemplo, Mac OS X, Windows, Linux).


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