Epopeya Un marco de software modular para el análisis y la visualización filogenéticos.
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Un marco de software modular para el análisis y la visualización filogenéticos. Presentamos EPOS, un marco de software modular para el análisis y la visualización filogenéticos. El software filogenético existente se puede dividir en dos grupos. Paquetes algorítmicos que proporcionan métodos computacionales para un problema específico y herramientas de visualización para analizar los resultados. Muchas herramientas algorítmicas carecen de usabilidad, ya que a menudo se basan en la línea de comandos, mientras que las visualizaciones a menudo sufren de malas interfaces gráficas de usuario. EPOS llena esta brecha combinando una poderosa interfaz de usuario gráfica con un sistema de complemento que permite la integración simple de nuevos algoritmos, visualizaciones y estructuras de datos. Una interfaz consistente se usa para administrar los datos o para iniciar los métodos de computación disponibles, desconectando el flujo de trabajo de los datos. o métodos aplicados. Actualmente, las EPOS proporcionan algoritmos para la reconstrucción de árboles a distancia, las distancias de los árboles, los árboles de consenso y los métodos supertree. Todos los métodos se integran en un sistema de tuberías que permite combinaciones de métodos que se ejecutan secuencialmente, donde el sistema maneja el flujo de datos automáticamente. Una vista integral de árbol está incluida en las OPOS. Ofrece diferentes diseños, coloración, anotación y funciones de exportación y es capaz de procesar suavemente los árboles hasta unos pocos miles de hojas. Como las visualizaciones son parte del sistema modular, se pueden extender en cualquier dirección y se pueden integrar nuevos módulos de visualización para manejar, por ejemplo, redes filogenéticas. Para simplificar el manejo de datos, las EPOS le permiten al usuario crear un espacio de trabajo persistente que contenga todos los conjuntos de datos utilizados. La información dentro del espacio de trabajo se almacena persistentemente en un módulo de backend extensible y transparente. Requisements: · 256 MB, mejor 512 MB de RAM FREE What's New en esta versión: · No contiene ninguna característica nueva, pero corrige algunos de los errores más aniales, incluidos los problemas "No uses espacios en su ruta de instalación".

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