Espectáculos realiza análisis en experimentos de chip-seq
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Realiza un análisis en experimentos con chip-seq. FindPeaks es un software gratuito desarrollado para realizar un análisis de los experimentos de CHIP-SEQ. FindPeaks utiliza un algoritmo ingenuo para identificar regiones de alta cobertura, que representan el enriquecimiento de inmunoprecipitación de cromatina de fragmentos de secuencia, lo que indica la ubicación de una proteína de interés unida. Se usa un umbral de altura mínimo para determinar qué "picos" se muestran en el archivo de WIG compatible UCSC: si no se usa un umbral, se muestran todas las lecturas. FindPeaks recoge y ordena las lecturas a lo largo de cada cromosomas e identifica áreas de enriquecimiento, denominadas "picos". Estos picos son particularmente importantes en los experimentos de inmunoprecipiación de la cromatina (experimentos de CHIP-SEQ o Chip-Solexa), ya que indican la ubicación de una proteína de interés unida. Requisitos: · Java ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: · BUGFIX: Valores FDR normalizados

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