Espectador gambit Un visor de plataformas cruzadas y un banco de trabajo de análisis para datos de secuenciación de próxima generación
Descargar ahora

Espectador gambit Clasificación y resumen

Espectador gambit Etiquetas

visualizar secuencia analizar análisis de secuencia Visor de datos de secuencia analizar el cromosoma

Espectador gambit Descripción

Un visor de plataformas cruzadas y un banco de trabajo de análisis para datos de secuenciación de próxima generación El Visor Gambit es una nueva aplicación de interfaz de usuario gráfica (GUI) que tiene como objetivo ayudarlo con el análisis de secuencia. El software Gambit Viewer se aprovecha de las características de indexación del formato de alineación de secuencia BAM (bastante) que permite un rápido acceso a genómico. Datos, con tiempo de inicio mínimo y retraso en reinicio. El Visor de Gambit también admite una variedad de formatos de anotación (cama, GFF, GFF3, VCF) "Out-of-the-Box" para mostrar anotaciones de genes / región, así como entradas de SNP. El Visor de Gambits está actualmente "complementario" Con respecto al soporte de formato, lo que significa que se puede agregar soporte para nuevos formatos sin necesidad de modificar / actualizar el programa principal en sí. El análisis de bioinformática de los datos de secuencia actualmente requiere experiencia especializada y se está convirtiendo rápidamente en un cuello de botella. Se pueden servir las necesidades de análisis de los laboratorios de biología más pequeños si el software de visualización integra una funcionalidad analítica esencial. Dicha funcionalidad incluye el diseño de imprimación de PCR para apoyar los experimentos de validación del SNP del candidato; conectando a bases de datos comunes; Exportación de datos de regiones específicas del cromosoma para un análisis detallado y enfocado. El visor de Gambits pronto será "consciente de los complementos" con respecto a las herramientas analíticas para proporcionar dichas funciones integradas. Un beneficio de implementar el sistema de análisis a través de los complementos es que cualquier persona con habilidades de programación puede incluir fácilmente sus propias características personalizadas: soporte para nuevos formatos de archivo, métricas adicionales o incluso vistas personalizadas. Otro beneficio es que los usuarios no necesitan agregar cada complemento. Podrá personalizar el visor de Gambit para que sea tan liviano o completamente funcional como lo requieran sus necesidades. Requisitos: · Java

Espectador gambit Software relacionado