Filococo Phylococo: una herramienta simple para la estimación filogenética molecular.
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Filococo Descripción

Phylococo: una herramienta simple para la estimación filogenética molecular. Phylococo es una herramienta libre y minimalista para filogenéticas moleculares que es capaz de reconstruir filogenias mediante el criterio de probabilidad. Phylococo Selecciona automáticamente el mejor modelo de sustitución de la evolución de ADN para que se analicen el conjunto de datos de secuencias y se muestren después de un corto tiempo, la mejor filogenia hasta ahora se encontró. Philogenética molecular estudia las relaciones evolutivas jerárquicas entre los organismos por medio de datos moleculares. Estas relaciones se describen típicamente a través de un árbol ponderado, llamado filogenia, cuyas hojas representan los organismos observados, los vértices internos representan los ancestros intermedios, y los bordes representan relaciones evolutivas entre pares de organismos. Hay algunas características clave de "filococo": · la Modelo GTR de la evolución de ADN. · Distribución gamma al modelo entre la tasa de heterogeneidad de la tasa del sitio. · Direcciones aleatorias, algoritmo de Brent y búsqueda aleatoria de la optimización no lineal sin restricciones de los parámetros de probabilidad. · Búsqueda de vecindario de gran escala (VLSN). Búsqueda de la optimización de topología. -Escribe la búsqueda local (ILS) para explorar el espacio de la solución. Recomendado: · Intel Core 2 DUO · Java 1.5 o superior. ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: · Mejora la velocidad y la estabilidad de toda la aplicación gráfica. · Soporta FIGTREE 1.2.1

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