Flagdb ++

Base de datos integradora en torno a los genomas de la planta
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Flagdb ++ Clasificación y resumen

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  • Rating:
  • Licencia:
  • Freeware
  • Precio:
  • FREE
  • Nombre del editor:
  • FLAGdb Team
  • Sitio web del editor:
  • http://urgv.evry.inra.fr/projects/FLAGdb++/
  • Sistemas operativos:
  • Mac OS X
  • Tamaño del archivo:
  • 1 KB

Flagdb ++ Etiquetas


Flagdb ++ Descripción

base de datos integrativa alrededor de genomas de plantas FLAGdb ++ es un visor genoma de la planta libre escrita en Java los genomas language.The la programación de las plantas modelo se utilizan como referencias físicas para reunir y combinar toda la información generada y por lo tanto para optimizar las predicciones funcionales. De hecho, la interpretación biológica de grandes cantidades de datos requiere su integración, organización y representación visual. La organización de los datos en torno a las secuencias de los cromosomas permite reducir la redundancia de la información y referencias, sino también para estudiar fácilmente los conceptos de synteny y la evolución del genoma y las relaciones entre la estructura y la función de los genes. Es sólo con esta visión general que el estudio funcional de genes y la búsqueda orthology serán posibles, teniendo en cuenta los patrones de regulación y funciones y relaciones de los genes en los estados fisiológicos particulares. Por lo tanto, el objetivo último de este proyecto es desarrollar una base de datos y herramientas bioinformáticas asociados basados ​​en la integración de datos genómicos en torno a una selección de genomas completos de plantas. Requisitos: · Java 1.4 o posterior ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: · Actualización de Arabidopsis y arroz genomas y su anotación · Integración de genoma y anotación Vitis 12x · Anotación Eugene del genoma Vitis · Integración de perfiles filogenéticos · Nueva Arabidopsis FST y GST · Actualización de todos los recursos de transcripción (EST y ADNc) · Integración del predicho Arabidopsis smallRNA · Las nuevas herramientas e interfaces dedicadas a orthology relaciones · Actualización de localización subcelular, la clasificación de la familia de genes y referencias cruzadas


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