Genodía Aplicación fácil de usar para realizar análisis de la genética de la población
Descargar ahora

Genodía Clasificación y resumen

Genodía Etiquetas

analizar análisis genético Analizar el conjunto genético analizar la varianza molecular conjunto genético varianza molecular

Genodía Descripción

aplicación fácil de usar para realizar análisis de la genética de poblaciones GenoDive es una aplicación fácil de usar para realizar el análisis de la genética de poblaciones. Cuenta con una interfaz de usuario intuitiva y fácil de usar, detrás de la cual se encuentran poderosas herramientas estadísticas. GenoDive puede manejar los datos genéticos, así como matrices de distancia y datos ecológicos, lo que le permite combinar datos de diferentes fuentes en un único análisis. GenoDive cuenta con varios análisis que no están disponibles en otros programas como el k-medias basados ​​en la agrupación AMOVA, pruebas para la reproducción clonal y AMOVA de datos para poliploides, y los coeficientes estandarizados de población differentiation.And, lo mejor de todo, GenoDive trabaja en un Mac! aquí están algunas características clave de "GenoDive": · muchos tipos diferentes de inferencias: GenoDive cuenta con muchos tipos diferentes de inferencia estadística, algunos de los cuales no están disponibles en ningún otro software genética de poblaciones. inferencias incluidos son entre otros: un análisis flexible de la varianza molecular, la estimación de los coeficientes estandarizados de diferenciación de la población, k-means clustering de las poblaciones utilizando un enfoque de recocido simulado, la asignación de identidad genotípica (clones) a los individuos, las pruebas para la reproducción clonal, las pruebas de Hardy- Weinberg, cálculo del índice híbrido para los individuos, y diferentes tipos de pruebas de Mantel. · Analizar múltiples conjuntos de datos ... al mismo tiempo! Todos los Mac que se venden hoy en día contienen múltiples núcleos de procesador. Sin embargo, la mayoría de los programas son capaces de utilizar sólo una parte de la potencia de estas nuevas computadoras ya que emplean un solo procesador a la vez. GenoDive detecta automáticamente el número de procesadores presentes en las tareas de la computadora y divide prolongado más de todos ellos. Los cálculos siempre se realizan en segundo plano, por lo que se pueden realizar otros análisis a la espera de los resultados de un análisis más largo. · Formatos de datos múltiples: GenoDive puede manejar tres tipos diferentes de datos: markerdata (por ejemplo, de microsatélites), matrices de distancia (por ejemplo, dos a dos distancias genéticas entre las poblaciones), y otros datos genéricos (por ejemplo, las coordenadas de las poblaciones), que se pueden combinar en el inferencias estadísticas. Importación de datos en GenoDive es fácil: basta con abrir un archivo y GenoDive determinará automáticamente el tipo de datos que es y va a cargar los datos en la memoria. GenoDive incluso detectar si markerdata está en GenoDive, Fstat, Genepop, Spagedi, Genetix, BayesAss, estructura o formato de Migración. · Incluyen fácilmente y no incluyen observaciones: La mayoría de los conjuntos de datos de la vida real están lejos de ser perfecta, algunos loci puede ser más difícil de conseguir que otros y que siempre habrá personas cuyo ADN-ADN de extracción dado de baja calidad. En la mayoría de los programas de este medio de salir del programa, editar el archivo de entrada y luego reiniciar el programa de nuevo con el nuevo archivo. GenoDive hace que sea fácil de incluir o excluir loci, los individuos, los clones, los niveles de ploidía, poblaciones, o incluso grupos enteros de la población, por lo que el efecto de los valores extremos en el resultado de los análisis se puede evaluar. · Una visión clara sobre sus datos: GenoDive tiene un claro despejado, interfaz, que hace que sea más fácil para usted para mantener una visión general de los datos y análisis. Se puede elegir entre ver los datos como texto plano o viéndolo como una matriz. El panel muestra inspector la información importante más para los datos actuales: cuántas personas están incluidos por la población, el número de grupos de población, que loci están incluidos, el número de alelos por locus y un registro con los análisis que se han realizado en este conjunto de datos. · Amplias opciones de búsqueda: Con GenoDive usted puede buscar sus datos de diferentes maneras: por alelo, por nombre individual, por la población, por el clon, o por todas esas categorías al mismo tiempo. La búsqueda puede ser muy específico: por ejemplo, se puede buscar todos los nombres de población que comienzan con la cadena "NL" o todos los alelos que son más de 150 bp.NOTE: Esta es una versión pública preliminar que Nmeans que la aplicación todavía contiene errores, y algunos análisis todavía no se aplican plenamente. Si se utiliza esta versión beta, que están obligados por el honor de informar de cualquier problema, insectos o elogio que puede tener al autor. ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: · Mejora de la compatibilidad con Mac OS 10.6 "Snow Leopard". · Eliminado posibilidad de mostrar la pantalla de bienvenida al iniciar, ya que esto podría dar lugar a accidentes. · Solución de error en la lectura del formato de Genepop. · Reestructuración interna de los procedimientos de asignación.

Genodía Software relacionado