Imas Un sistema gratuito para el descubrimiento del conocimiento en la información genómica
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Imas Descripción

Un sistema gratuito para el descubrimiento del conocimiento en la información genómica. IMAS (el sistema de análisis multigenómico interactivo) es un sistema analítico visual de código abierto y libre para el descubrimiento del conocimiento en la información genómica. IMAS permite a los científicos genómicos analizar rápidamente un conjunto de secuencias genómicas microbianas utilizando herramientas como Glimmer, Blast, Clustalw, Primer3 y TransSTERT y para visualizar la salida de estas herramientas en un marco genómico unificado. Proporciona al usuario un zoom 1 dimensional Interfaz gráfica a una secuencia genómica. El usuario puede interactuar con la secuencia para analizar la presencia de regiones de codificación, que se pueden analizar aún más por la alineación de la secuencia con bases de datos locales y remotas que se utilizan. Los resultados de las explosiones se muestran en un marco gráfico unificado que le permite al usuario filtrar y seleccionar los hits de explosión de interés. Los hits BLAST seleccionados se pueden obtener multializados usando Clustalw, y estas multialignas se muestran utilizando el marco gráfico común. Los usuarios futuros y las alineaciones de las multialignas y las alineaciones de pares pueden ser anotadas para futuras referencias, y se pueden generar informes HTML que muestran estos hallazgos.

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