Investigacion Probe: evaluar el embalaje atómico, ya sea dentro o entre las moléculas
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Probe: evaluar el embalaje atómico, ya sea dentro o entre las moléculas La sonda permite que uno evalúe el embalaje atómico, ya sea dentro o entre las moléculas. Genera "puntos de contacto" donde los átomos están en contacto cercano. La sonda lee las coordenadas atómicas de los archivos de formato de proteínas de datos (PDB) y escribe listas de puntos para su inclusión en un archivo de kinemage. Alternativamente, la información de embalaje se puede cuantificar y mostrar en una tabla de puntajes de la lista para las interacciones de Van der Waals, enlaces H y superposiciones atómicas ("choques"). Además, la sonda también puede generar fácilmente las superficies de contacto dentro de un conjunto de átomos ("autopartes") e incluso "puntos de superficie" donde no hay átomos cercanos.

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