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Adapta el uso del codón a los organismos procariotas secuenciados. JCAT es un programa gratuito que presenta un método simple para adaptar el uso del codón a los organismos procariotas más secuenciados y los organismos eucariotas seleccionados. La adaptación de codones desempeña un papel importante en los casos en que se expresan genes extranjeros en los hosts y el uso de codón del huésped difiere de la del organismo en el que el gen proviene de. Los codones no adaptados en el host pueden, por ejemplo, llevar a una tasa de expresión menor. La adaptación se basa en los valores de CAI propuestos por PM Sharp Et.al. Los valores CAI se calcularon aplicando un algoritmo de un carbone et. Alabama. Los genomas eucarióticos del ratón y el humano contienen diferentes tipos de sesgos a lo largo de los cromosomas y el algoritmo no es perfectamente adecuado para este problema. Los resultados en este campo deben ser manejados con cuidado. El uso de codón promedio para un determinado organismo se derivó sumando sobre todos los valores de CAI de todos los genes de este organismo (excepto los genes sin una secuencia de aminoácidos, por ejemplo, los ARN) se han curado por el número de genes. Estos datos también se presentan en la salida gráfica de la adaptación del codón. Requisitos: · Java 1.4 o posterior

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